Basic Information

Symbol
LDHC
RNA class
mRNA
Alias
Lactate Dehydrogenase C CT32 Cancer/Testis Antigen 32 L-Lactate Dehydrogenase C Chain LDH Testis Subunit EC 1.1.1.27 LDH-C LDH-X LDH3 LDHX Testis Secretory Sperm-Binding Protein Li 234P Lactate Dehydrogenase C4 EC 1.1.1
Location (GRCh38)
11:18412306-18452063
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017448.5
Sequence length
2035.0 nt
GC content
0.3956

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-560.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -603.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 497.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002301.5 NCBI
GAGUCGCACGGAGGGCAACCGUCGACGGGCUUAGCGCCUCAACUGUCGU… 2089 nt 0.3983
NM_017448.5 NCBI
GAGUCGCACGGAGGGCAACCGUCGACGGGCUUAGCGCCUCAACUGUCGU… 2035 nt 0.3956
Summary

Lactate dehydrogenase C catalyzes the conversion of L-lactate and NAD to pyruvate and NADH in the final step of anaerobic glycolysis. LDHC is testis-specific and belongs to the lactate dehydrogenase family. Two transcript variants have been detected which differ in the 5' untranslated region. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human body fluids identified the LDHC as a semen-specific marker candidate listed in the initial screening [Liu et al. DOI:10.1007/s00414-019-02027-y].