Basic Information

Symbol
LDLRAP1
RNA class
mRNA
Alias
Low Density Lipoprotein Receptor Adaptor Protein 1 ARH FHCB1 FHCB2 ARH2 Low Density Lipoprotein Receptor Adapter Protein 1 Autosomal Recessive Hypercholesterolemia Protein DKFZp586D0624 MGC34705 Autosomal Recessive Hypercholesterolemia LDL Receptor Adaptor Protein FHCL4 ARH1
Location (GRCh38)
1:25543573-25591200
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015627.3
Sequence length
2914.0 nt
GC content
0.5745

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1144.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1196.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1009.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_015627.3 NCBI
GGAGCGCGCAGCCCGCGCGCCGCAGGGCCGGGCGGAAAGUUUUUCCUGA… 2914 nt 0.5745
Summary

The protein encoded by this gene is a cytosolic protein which contains a phosphotyrosine binding (PTD) domain. The PTD domain has been found to interact with the cytoplasmic tail of the LDL receptor. Mutations in this gene lead to LDL receptor malfunction and cause the disorder autosomal recessive hypercholesterolaemia. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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