Basic Information

Symbol
LECT2
RNA class
mRNA
Alias
Leukocyte Cell Derived Chemotaxin 2 Chm-II Chm2 Leukocyte Cell-Derived Chemotaxin-2 Leukocyte Cell-Derived Chemotaxin 2 Chondromodulin-II LECT-2 HLECT2
Location (GRCh38)
5:135922279-135954983
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002302.3
Sequence length
1033.0 nt
GC content
0.3911

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-249.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -270.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 243.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002302.3 NCBI
UAAACUUUUUGUGUCUCACACUAAAGAAAUGAGAGAUGCAGAAUUCUAA… 1033 nt 0.3911
Summary

This gene encodes a secreted, 16 kDa protein that acts as a chemotactic factor to neutrophils and stimulates the growth of chondrocytes and osteoblasts. This protein has high sequence similarity to the chondromodulin repeat regions of the chicken myb-induced myeloid 1 protein. A polymorphism in this gene may be associated with rheumatoid arthritis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.