Basic Information

Symbol
LEFTY1
RNA class
mRNA
Alias
Left-Right Determination Factor 1 LEFTYB LEFTB Left-Right Determination Factor B Protein Lefty-1 Protein Lefty-B Left-Right Determination, Factor B
Location (GRCh38)
1:225886279-225911382
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020997.4
Sequence length
1626.0 nt
GC content
0.6218

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-734.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -763.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 328.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_020997.4 NCBI
ACAUCCAGCUGCCUGAGACCCUCCUGCAGCCUUCUCAAGGGACAGCCCC… 1626 nt 0.6218
Summary

This gene encodes a secreted ligand of the TGF-beta (transforming growth factor-beta) superfamily of proteins. Ligands of this family bind various TGF-beta receptors leading to recruitment and activation of SMAD family transcription factors that regulate gene expression. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate the mature protein, which plays a role in left-right asymmetry determination of organ systems during development. This gene is closely linked to both a related family member and a related pseudogene. [provided by RefSeq, Aug 2016]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.