Basic Information

Symbol
LEPROT
RNA class
mRNA
Alias
Leptin Receptor Overlapping Transcript OB-RGRP Endospanin-1 OBRGRP VPS55 Leptin Receptor Overlapping Transcript Protein Leptin Receptor Gene-Related Protein OB-R Gene-Related Protein Endospanin FLJ90360 LEPR DnaJ (Hsp40) Homolog, Subfamily C, Member 6 Leptin Receptor Gene Related Protein OBR
Location (GRCh38)
1:65420587-65436007
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017526.5
Sequence length
4541.0 nt
GC content
0.3959

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1201.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1288.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1411.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((.((......))...))))..))))))(((((((((.(..((((..(((((.((((......)))))))))......))))..).)))))))...(((((((...((.(((((((((((((.((....((((((((.((((..((........))..)))).))))))))...)))))))).......(((((((((((.((((...(((.((...(((((.((((.(((((((((((((..((((((...))))))........))))))))).....)))).)))).....((....)).)))))...)))))...)))).))))...))))))).((((((.(.(....).).))))))(((((((((((((((((..(((...(((((....)))))....)))..)).))))))))))...((((((.((((((((.(((((.((.......)).)))))..(((((((((((((....((((.....))))....(((.(((((((((((.(((..........))).))))))(((........))).........))))).))))))))))))...))))...((((((((((.((.....((((((((.....((((((.((((((((((((((...(((((.....((((..((((((((((......)))))((((.......(((...((((((((((((((....(((((((....(((((..(((.((((....(((((..(((.((((((((.(((((....))))).))...((....)).(((((.((........)).)))))(((((((....(((((.((.((((.(.(((((((......))))))).).)))))).))))).....(((.(((((.((..((((((((((.((.....((((...((.......))...)))).)))))))))))).))...))))).))).....(((((((((.(((((.........(((((..((((......(((((((......(((.......(((((.....))))))))......)))))))....))))..)))))..................)))))...)))))))))(((((((((..((((((.(..(..(((((.......))))).)..).)).......))))...)))))))))....((((((.(((...(((((((((.((.......(((.(((((....(((((((((....)))))))))(((((((((((........(((.((((.(((((.......))))))))).)))(((((.....))))).(((.(((((.................))))).)))))))).....))))))..))))).)))......................)).)))))))))......((((((((....))))..)))).........................))).)))))).........((((((((((((...((((((........)))))).........(((........))))))))))))))).((((((((.((((((.......))))))(((((....)))))..((((((((((((((((................))).....)))))....))))))))..........)))))))).)))))))....)))))))))....)))))((((((...(((((.(((.............))).)))))..)))).)).......)))))))..)))))..))))))).....)))..)))))))))))....))).))))..((((((.....))))))..((((((.((....((((((.((...(((((((((..((((((...(((.((((....((.((..(((((((.((((....(((.....))).....))))..)))))))..)).))))))...)))..))).))).))))..)))))..))))))))....)))))))).......((((.....)))))))))..))))..)))))...))))))))))))..)).))))))....))))))))((.(((((.((((((.........(((((..(((((.(((((((......(.(((.((.(((.((((((((((....(((((((((((....))))).((((((((((.((((...((.((((....)))).))((((((((..((...))..))))))))....)))).)))))))))))))))).))))....(((((((((.........(((((((....)))))))..(((.(((((((((((((((..(((((.(((.......))).)))))...)))))))))))..)))).))).......((((((.((........)).))))))...((((...(((((((((..(((((.((((....((((((((.......(((.(((((((((((((.((((..(((((((((((((((((((((((.........(((.((((((((.............)))).))))))).....(((((.((........)).)))))..................((((((........))))))((((((((.......)))))))))))))))...)))))))...)))))....)))))))).)))))))))..))))..))).......))))))...))....))))..)))))..))))))))).))))....)))))))))))))))))).)).))).)....))))))).)))))....)))))..(((((((.(.((((..(((((((....)))))))..((((.((((((.......((..(((((((.....((((((((.(((((((....)))....))))...))))))))..((((.(((((((....((((((....(((((..(((.(((....))))))..))))).......)))))).(((((.....))))).(((((.....((((...))))..))))).((((.............))))...((((((...((((((((.((((((((.(..((((.....((((.(((((.(.((((.(.((((..(((((((...(((........)))...)))))))..))))((((.......))))...............................((((.((.((...((((...(((.((((((............))))))...))).)))))).))..)))).....((((......))))...............).))))).)))))))))..))))..).))))(((((..(((((.((((....)).)).))))))))))....))))..))).)))))))))))))))))).)))).)))))))..))......)))))).))))...(((((((........(((....((..(((((.(((..(((((....(((((((...))))))).(((........))).((((((((.....))))))))....(((((........))))).))))).((.((((((.((..(((((..(((((((((......))))))((((((((...((((((.((((.((((((((((.(((..........((....))...........)))))).)))))))..(((....))).....)))).))))))..........)))))))).............(((((((.((....))))))))))))..)))))..)).)))))).)).....))))))))..))...)))))))))).)))).).))))))).............)))))).))))).))(((((((...))))))).((((((((.((((((((((((.((.......)))))))))..)))))))))...))))....)))).))))))))((((((.(((...)))))))))......(((....)))..((.((((((((((.............)))))..((.(((((...((((((.....(((((.(((....))))))))....))))))..))))).)).....(((((......)))))...))))).)).)))))))).)))))).(((((.((..(((((((...)))))))..)).)))))((((((..(((((.........)))))..))))))..))))).....))))))).)))))))))((((((((....((((.((((((...)))))))))))))))))))).........(((((.((((((((((((((.((..((((..(((......)))...........(((((....)))))..............(((.......(((((...))))).......)))..))))..))...))))).))...))))))).)))))...(((.(((((......))))).)))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((...((((((((((.|....,.....,).))))))))))}}}},.(((({.(({(((((((,.....||||,,{{((((,,,|{{{(((((((({{{..{(({((({....,,{{(((({((((,({((....({(((,{(,((((,.,{..,{,...,}..})}).})}}},}}.},))))),})},.....(((((((((((.((((...((({{{...(((((.((((.(((((((((((((..((((((...))))))........)))))))))....,)))).)))).....((....}}.)))))...}))))...)))).))))...))))))).((((((.(.,....).).))))))...,,((((((((((((,.(((...(((((....}))))..,.))).,)).)))))))))}...{(((((,(((((({{.(((((.{{.......}}.})))){,{(({{{{{.{{(,,.,,{,,{..,,{||||..,{(((({{{.|,{{{{{...,,}|,||||||}}|||||||((((........))),.,},|,.((((.(((((((.{.(({....))).,)))).))).)))).,,,||.{(((((({.....((((((.{{((((((((((((...(((({{{{{,{{{...{{||{({{{{{,,.,||}}|}{{(({{{,...{({.,.((((((((((({((...,(((((((.{..(((((..(((.((((....{((((..,{(,(((((((,,(((((.,.,|||||.|....{{....)).(((((.((........)).)))))(((((((....(((((.((.((((.(.(((((((......))))))).).)))))).))))).....(((.(((((.((..((((((((((((({.,..{(({..,,,,,..,.,))...}}}).)))))))))))).))...))))}.)))..,..(((((((((.(((((.........,{{((,,((({......(((((((......{{{.......(((((.....)))))}}}......)))))))....))))..}|}}}..................)))))...)))))))))(((((((((..{((({,.{.....(((((.......)))))......,,..,,...)))}...)))))))))....((((((.(((...(((((((((.,(({{.....,|}||,.,....(((((((((....))))))))),{(((,.,,,|}}......(((.(((,,(((((.......))))))))).)))(((((.....))))).(((.(((((.................))))).)))|||,,....,||||||..,,,.,.,.}}}},,,.........,.......,.}))))))))......{{{{((({....)))}..,}}}.........................))).)))))).........(((((((((((({..((((((........)))))).........,((........}}))))))))))))).((((((((.((((((......,))))))(((((....)))))..((((((((((((((((.,,.............}}}.....)))))....))))))))........,,)})))))).)))))))...})))))}}})....))))){{{,{{,..,,||,..|||,,({{,,(((,..,...}})}...})))))),.....)))))))..)))))..))))))).....))).,))))))))))).,,,}}}.,,||,.((((({.....})))}}..{{{(({.{{.,..((((((.({.,.{((((((((..((((((.,.{((.((((....((.((..(((((((.((((....{((.....})).....))))..)))))))..)).)}))))...)))..))).))).})))..))))).,))))))))..,,)}}}}})),|},,..|||,..,},,})},}}}),.))))..)))))...})))))))))))..,,.)))))).,,.)))))))},|||||{{{{,,{,{{..{({({.,{{|||||(((,,{{{,{|||....,)))}.}))),|}},})))}})}}}}}}|}}}}}}})}))}))))))),((((((((((.((((..,((.((((....)))).))|(((((((..((...))..)))))))}....)))).)))))))))),.||||.,,|||||{|(((((({|.,.......(((((((....)))))))..,,..||,{{{{{{((((((,.(((((.(((.......))).)))))...}|||||||||||,||||{||{{{,....(({(((,((,,......}}.||}}}}...||||...(((((((((..(((((.{(((,...{(((((((...,..,(((,((((((((((((({((({..(((((((((((((((((((((((,,,{,{,,,,({,{{||{||{..,{{{{{,..,.,,,,.,,..,,,.....{((((.({........)).)))}}.,,}||.,......,,.{((((((........))))))|{{{{{||}}}....})))),,,))))))}...)))))))...)))))...,))}}}}))})))))))))..}))).}))).....,.)))))),..,},...}}))..)))))..))))))))).}}}}...,}}},,}}}},.,||{|||{||{|||.|{..,|||||.|.})}}},...,}||{....|||{{{({,{{{||({(((({....,)))))).,))))}..,)))))...))|})}},.})),,,.||{{(({|{{|{,,,,|||||||}||||.,,||||,,|}}}||,..||}}}}}}}))}}},,|(((((({,.,{((..{{{...}))..}}))))))))}......,.,|||||||}}||{||||}..||||{,||||||,.{((({,..|||||..{{,{((((((................)))))))}}.,,})}}))}}},,))}}}||||{(((({{{({({(.(((((.,(((((({,.(({(,,(((((((...(((........))).|||||}}}}..)))}|{({.......)))}...........}}}|||,,,|||{.|||,,,|{{|||||||}|||||......)}|||(((,,,,.......,||}}}}..{(((((((({......(((.........}}}....)))))))}},,.....,,||||}},}.,..((((((..(((((..(((((((.,....,...}))))))...,,)})).}..)))))),,{{{{(((((,,...,((({{{,...|.,,,..,)))))),..,,,,.,,,,,..,|,...{{{{||||....{||{..{{((......|,|{{{{,|,,|||.((.,,....))}}|,,,,},))))),,......}}}}.,,|{((((,,,,...},))))))))}...((({{,,,.....))))).}}||,...,|||||||,,.,,,.,,.,}||((((((,....,))))))....{(({.(((((((...)))))))...}))).}}}},,}}}},,,}}})))))}}}}}.,,|{{},.,,.,}))}}}}..|{{,,,,}}|,,..,,,,|||||},}.}}}},....{((((.....))))|((((..((((((((((....)))))))))))))},,,,..,}}.,,,}}}.,,.},)))))))),,..))}}}||{||||.{{{|...})))..............................{||{((((((,...||,,||,.((((((((.((((((((((((.((.......)))))))))..}))))))))...)))).)),))....))))))}))))}...||},.(((({({|,....},}})))),}}}|}|,..|{||||||||,,}..}}}}.}}}})}},.,||{(({{...{{||{|,,,|,||||{.||{...,}}}})}})....)}}))).,))))}|||.}|,}||||{....{{||||,.,,,||||....)))}}))).)))))){(((((.((..(((((({...}))))))..)).)))))|(((((,.(((((.........))))),.)))))},,}}}}.}}}},})))))).|||||||,((((((((,...{((((.((((({...))))))))))))))))))).,...,,,..,{{,{.{{{{{{{{{{{((({((..{(({,.{,,..,,,,,}},,.....,,,,|({({....)))))....................,||.|||||...})}}}....,,}}}|,,}}}}..,,...|||}|,}|.,,}}}}}}).}))))},}})},,,|,.....},))))}}}}},,....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001198681.2 NCBI
AGGCUGCCCGGGCCGUGGCAGGAAGCCGGAAGCAGCCGCGGCCCCAGUU… 4673 nt 0.3972
NM_001198683.2 NCBI
AGGCUGCCCGGGCCGUGGCAGGAAGCCGGAAGCAGCCGCGGCCCCAGUU… 377 nt 0.4881
NM_017526.5 NCBI
AGGCUGCCCGGGCCGUGGCAGGAAGCCGGAAGCAGCCGCGGCCCCAGUU… 4541 nt 0.3959
Summary

LEPROT is associated with the Golgi complex and endosomes and has a role in cell surface expression of growth hormone receptor (GHR; MIM 600946) and leptin receptor (OBR, or LEPR; MIM 601007), thereby altering receptor-mediated cell signaling (Couturier et al., 2007 [PubMed 18042720]; Touvier et al., 2009 [PubMed 19907080]).[supplied by OMIM, Jul 2010]

Forensic Context

A study in human skin wound healing identified the LEPROT as a marker for papillary FB-III fibroblasts [Liu et al. DOI:10.1016/j.stem.2024.11.013]. A scoping review of human twin studies found that the LEPROT exhibited increased mRNA expression in human umbilical vein endothelial cells (HUVECs), where its expression was negatively correlated with birth weight [Dany Laure Wadji et al. DOI:10.1371/journal.pone.0315549].