Basic Information

Symbol
LGALS4
RNA class
mRNA
Alias
Galectin 4 GAL4 Lectin, Galactoside-Binding, Soluble, 4 L-36 Lactose-Binding Protein Lactose-Binding Lectin 4 Antigen NY-CO-27 Galectin-4 L36LBP Gal-4
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_006149.4
Sequence length
1121.0 nt
GC content
0.5629

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-400.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -418.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 175.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.((((.(.((((((((.........(((((((.((.....(.(((((((((((((.(((..(((((...((.(((((...((.(((((.((((((.....(((((((......((.((((.....))))))((((....(((..((((......)))))))..)))))).)))))....(((((((.....)))))))....)))))).))))).)).)))))))...))))).))).))..............)))))).))))).)....)))))))))......))))))))).)))).))))((((((..((((((((.(((((((..((((((....)))))).(((((((.(((.((((...(((((((((.((...)).......(((((((((...(((.....(((((((((.((..(((((..((((((..((...((((((...((((......))))..((((..(((...((((.................))))..)))))))(((((..((((((.....................))))))..)))))....))))))...))..))..))))))))))))))))))))....))).((((((..((.((((..........)))).)).)).)))).(((((...))))).....)))))))))....)))))))))(((((.....)))))..(((...))))))).))).)))))))))))))).(((((..................)))))((((((((((.(((...(((((((((.(((((...((((((((...(((((((((............)))).)))))...))))))))....((((((.((...)).))))))....)))))...)))))))))....((((....(((...)))....)))).....))))))))))).))(((((((....)).))))).(((((....(((....(((((((....))))))))))..)))))((((...))))..((((((((..((((.((.((......)))).)))).)))))))).))))))))..))((((.............))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((.((((.(.((((((((.........(((((((.((.....(.(((((((((((((.(((..(((((...((.(((((...((.(((((.((((({.....(((((((......((.((((.....)))))){(((....{{({.,(((......))))))}..)))))),})))),{..(((((((.....)))))))..}})))))).))))).)).)))))))...))))).))).))..............)))))).))))).)....)))))))))......))))))))).)))).))))(({,((..((((((((.(((((((..((((((....)))))),(((((((,(((,((({{{.{..||{||({{|{(,((((....(((((({((,...(((.....(((((((((.((..(((((..((((((..((...((((({...((((......))))..((((..(((...((((.................)))),.)))))))(((((..((((((......,.......,......))))))..)))))....))))))...))..))..)))))))))))))))))))),...))).,,.}},..)}))}})))},......,|||||||||,,.{|,{{{(,,,.|||||||.{,.......,,..,..}}})).))|||||,},..}}|)|,,,}}}}})}}},},.}}}.)))))))))))))).(((((....{,...,,.......)))))({((((((((.({{...(((((((((.(((((...((((((((.,.(((((((((,........,..)))).))))).,.))))))))....((((((.((...)).))))))....)))))..,}))))))))..,,((((....(((...)))....))))...,}))})))))))).}|(((({((....)),))))}{(((((....(((....(((((((....))))))))))..)))))|{{,...,}},..((((((((..((((.((.((......)))).)))).)))))))).))))))))..)){||{............,||}},,}),,.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
ACCAUCUCCCACUCCUGCAGCUCUUCUCACAGGACCAGCCACUAGCGCA… 1121 nt 0.5629
Summary

The galectins are a family of beta-galactoside-binding proteins implicated in modulating cell-cell and cell-matrix interactions. The expression of this gene is restricted to small intestine, colon, and rectum, and it is underexpressed in colorectal cancer. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.