Basic Information

Symbol
LGR4
RNA class
mRNA
Alias
Leucine Rich Repeat Containing G Protein-Coupled Receptor 4 GPR48 Leucine-Rich Repeat-Containing G-Protein Coupled Receptor 4 G Protein-Coupled Receptor 48 G-Protein Coupled Receptor 48 BNMD17 DPSL
Location (GRCh38)
11:27365961-27472821
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018490.5
Sequence length
5250.0 nt
GC content
0.4215

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1578.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1673.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1196.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001346432.2 NCBI
AGAGCGUGCAACCCUAGAAGGGAAAAGGACGGGAAGAGAUUGAGCCGCG… 5178 nt 0.4224
NM_018490.5 NCBI
AGAGCGUGCAACCCUAGAAGGGAAAAGGACGGGAAGAGAUUGAGCCGCG… 5250 nt 0.4215
Summary

The protein encoded by this gene is a G-protein coupled receptor that binds R-spondins and activates the Wnt signaling pathway. This Wnt signaling pathway activation is necessary for proper development of many organs of the body. [provided by RefSeq, Oct 2016]

Forensic Context

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