Basic Information

Symbol
LHFPL2
RNA class
mRNA
Alias
LHFPL Tetraspan Subfamily Member 2 KIAA0206 LHFPL Tetraspan Subfamily Member 2 Protein Lipoma HMGIC Fusion Partner-Like 2 Protein Lipoma HMGIC Fusion Partner-Like 2 LHFP-Like Protein 2
Location (GRCh38)
5:78485215-78770021
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005779.3
Sequence length
4977.0 nt
GC content
0.4579

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1575.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1667.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1360.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005779.3 NCBI
CUCCCUCUCCCCGAGUGCUAGCCCGGGCGGCCGCCGAGCUUGGCGCUCU… 4977 nt 0.4579
Summary

This gene is a member of the lipoma HMGIC fusion partner (LHFP) gene family, which is a subset of the superfamily of tetraspan transmembrane protein encoding genes. Mutations in one LHFP-like gene result in deafness in humans and mice, and a second LHFP-like gene is fused to a high-mobility group gene in a translocation-associated lipoma. Alternatively spliced transcript variants have been found, but their biological validity has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human patients identified the LHFPL2 as one of ten hub genes predictive of heart failure progression following myocardial infarction using a support vector machine recursive feature elimination algorithm [Xu et al. DOI:10.3389/fgene.2025.1592985].