Basic Information

Symbol
LIF
RNA class
mRNA
Alias
LIF Interleukin 6 Family Cytokine HILDA Leukemia Inhibitory Factor CDF DIA Differentiation Inhibitory Activity Cholinergic Differentiation Factor Differentiation-Stimulating Factor Hepatocyte-Stimulating Factor III Differentiation-Inducing Factor Melanoma-Derived LPL Inhibitor Human Interleukin In DA Cells D Factor MLPLI LIF, Interleukin 6 Family Cytokine Emfilermin
Location (GRCh38)
22:30240453-30246759
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002309.5
Sequence length
3871.0 nt
GC content
0.5709

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1604.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1672.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 885.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((.((...(....)...)).)))))))((.((((((((.((....(((.....)))...)).)))))))).))...((((((((((......(((((((((...((((...(((((((.((((((....)))))).....................((((.(((.........))).))))....)))))))..))))....))))))))).))))))))))...((((.......)))).(((((((((........(((.((((.((((.(((..(((((((...((((((...((((.((((((((...((.....))..(((((.(((((..(((((.(((((((....((...((((.....))))...))......)))))).).)))))....((((((((..((((((((.((((...........((((((.((..(((((.(....(((((((.((((((.(((.((((.((((((((((((((...)))).)).((.((((((((.....)))))))).))....((((((.((((....)))).))))))((((.((....)))))).)))))))).......(((((...((((((...((((...(((.((.(...........).)).))).))))))))))..))))).)).)).))).))).))).)))))))..).)))))..))..)).))))(((((........))))).))))..)))))).))..))))))))....((((.((((...(((((.(((....))).))))).))))...))))((((((((((((((((..(((.((((.......)))).)))))))))))..((((((.((((((((.((...........)))))))))).))))))...))))))))))))).)))))(((((((((((((.....((((.(((...((((....(((...(((((.(((......))).)))))(((((((.(((((((((((....))))).((((((((....((((((((.(.((((((((((((((((((....(((.....)))..))))))(((((((((((....))))))).))))..).)))))).)).)))).((((...))))..(((((....((((..........))))....))))))))))))).......)))))))))))))).)))))))..))).....))))..))).))))...))))))))..)))))..)).)))))).)))).))))))...))))))))))........(((((..((((((((((((((((.(((.((((((((((((((((((...........))))..)))).)))))))))).)))....((((........)))).((((.(((.((((.(((((((..(((....((((((....((((((((..(((((((((.(((((.((((((((((.(((((((...((.(((((...((((((((((((((....(((((((((((((((((..(((((..((((((((........)).)))))))))))(((((((((((((......)))).)))).....(((((((((((((.....)))))))))((((((.(((((.((((((...(((.((((((((((((...)).))))))).))).)))..))))))((..((((...(((((.(.......(((.(((((........))))).))).....).))))).))))..))...........))))).)))))).)))).............(((.(((((.((((......((((((((((((((((((..((((((((((((((.((((((...................((((((....(((((((((..((.(((((((((((.....(.((((..(((((((...(((((((((((((((...(((...((((((((((((.(((.((((.(((..((...(((((((.(((((((((.(((((((((.(((.........((((((((.....))))))))...(((.((((((((.((((.((((....((...((((((((((((((...))))).).))))(((((((((.((((.......))))....)))))))))((((((((((.((....))......)))).))))))........))))....))...)))).)))).)))))))))))))).)))))))))(((.((.((........)))).)))........)))).))))).)))))))..))..)))))))((((.(((((...))))).)))))))..)))))))......)))))....))).))))..(.(((....))).)((((.((((((((((((...(((((........)))))...))))))..)))))).))))........)))))))))))((.(((((((....))))))).))...((..((.((((((((((.((.((((..((.(.(((......))).).)).)))).)).)))))))))))).)).((((((.(((((((((((.(((((...))))))))))))))))((.((((.....)))).)))))))))))))))..)))))))))))..(((((.(((((((....)))))))..))).)).....((((((..(((((.((((.((((...........)))).)))))).))).)).))))((((((..((((...((((((...((((((...((((.((((((((....))).......((((.(((((((...((......)).))))))).)))).))))).))))))))))..))))))...))))..))))))...)))))))))))))))))))))).(((((((.((....))...)))))))...)))))).))..(((((....)))))......(((((((.((((.(((((..((((((...((.(((........)))))...)))))).))))).)))).))))))).)))))))))....)))))))))))))))).).))))..........(((.......))).....)))).))))).)))...)))))(((((.(((((.(((((((...(((((.(((...(((.((...(.(((.....))).).)).))))))..)).)))))))).)).))))).))))).......))))))))))).....((((((...)))))).))))))..))))))))))))............((((((((((....)))............((((((......)))))).(((...))).........)))))))....))...)))))))....))))..))).)))))))))).).)))).).))))).))).((((((((((((((((((((.(.((((....)))).).)).))...)))))))))))...)))))....(((.(((.(((((((.((.......))...)))))))))).)))(((((....)))))....)))))))))))))).)))))))))).)))).)))(((((((.........))))))).........))))...((((....))))))))))))))).............))))).)))))....((((.((...)).))))...)))).))))..))).......(((((((.((........)).))..))))).........(((((((((........)))))))))(((((((((((...)))))))))))....)))))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((.((...(,...}...}}.))))))}{,,((((((((.,{.{{,((,(((((({{.,.{{.(((.(((((((({,({(({{{{{{,,,,,.((((((((({..((((...(((((((.((((((....)))))).........,...........((((.(({.........})).)))}....)))))))..))))..},))))))))),|||||}||}}...})).,}))))}.}}}.||,||,,.,.........,.((((((((((,{,{,,}}}||,......}||(({.(((((((((.........,{(((.(((((((((((((,.{({{...})}.,),.)))))....)).)).)))))))).))))))))}..))).,,,{|||.,}.||||||||..{{{(((((,((({,,,....,,||{{{((((((,.(((((,(,,{,(((((({.((((((.{((.{{{{.((((((((((((((...)))}.)).((.((((((((.....)))))))).))....((((((.((((....)))).))))))((((.({....}))))).}))))))).,,....{{{{{...((((((,..((((.,.(((.((.{...........}.)).))}.)})))))))},,))))}.}},)),))),))).,)),)))))))....}}}}}..)),.)).))))))|||,..,,))))))})))}}}.,)))))),)),,)}}})))),...)))}},{{{...,||||||||,.,,))).||||,,)))}|||,,,(((((((((((((((((..(((.((((.......)))).)))))))))))..((((((.((((((((.((...........)))))))))).))))))...))))))))),,,||},||||||{,,,}}.,..(((((,..{(((((.(((((.{(((({,{{(((((.(((......))).)))))||,.,{,....,,((((((....))))))))).))),,))))).)))))))))))}}}))}}.,{(((({....(((.....)))..)))))}(((((((((((....))))))).)))).{{,(((((.(((((((....))).)))).)})))))....((((..{.((((((((..((.((((((((((((((((.((((((((.{,....((((((..((,{(((((((((((((,.,(((((,,((((((..{{{({(((....))))|..}}}}.)).,((((((.((.((((.(((......))).)))}.)))))))),..(((((((((.((((((((((((((((((...........))))},)))).)))))))))).))).))))))(((((((((((.....))))),.,....(((((((,,((..((..(((((.(((((((((((.,(({.((((((((((.((({,({,,(((((........((((((.(((...((((((((((((.,..(((((((((((((((({..(((((..((((((((......,.)).)))))))))))(((((((((((((......)))}}})))..,{(((((((((((((({...,)))))))))||((((.(((((.((((((...(((.((((((((((({...}),})))))).))).)))..))))))..{{(......}}|,{(({.,,.....,,|||||.,,,.....,,.{((((({...{((({{{...})},))))))))))}..))))).))))}},}}},.,|||........||{,||{({.{{|{,.....((((((((((((((((((..((((((((((((((.((((((.{,................((((((....(((((((((..((.(((((((((({....,(.((((..(((((((.{{(((((({((((((((...(((...(((((((((({(,(((.((((.,{,..,(,{,(((((((.(((((((((.(((((((((.(((........,((((((((.....)))))))),..{((.((((((((.((((.((((....({.,.((((((((((((({...})))).).))))(((((((((.((((.,...,.))))....)))))))))((((((((((.,,..,.||...,,.))))},))))}........)))).,..}}...)))).)))).))))))))))}))).))))))))){{{.{{.{(........|})),|||.....,,,)))).))))).))))))).}))},))))}))||{{.(((((..,)))}}.}}}}|}}..}}))))),.....)))))}...})).})))..,.{((,...,,)}}((((.((((((((((((...(((((........)))))...)))))),,)))))).)))).}}))}}})))))))}},|((.(((((((....)))))))}))...((..(({((((((((((.((,((({..((,(.{({......))),)})).)))}.}}.)))))))))))).)).((((((.(((((((((({,(((((...))))))))))))))))((.((((.....)))).)))))))))))))))..)))))))))))..({(((.(((((((....)))))))..))).)}....,(((({(..(((((.((((.((((.{........,)))).)))))).))).)).))))|(((((..((((...((((((...((((((...((((.((((((((....))).......((((.(((((((...((.....,)).))))))).)))).))))).))))))))))..))))))...))))..)))))}...)))))))))))))))))))))).(((((((.((....))...))))))).,.)))))).)),.(((((....)))))......(((((((.((((.(((((..((((((...((.(((........)))))...,))))),))))).)))).))))))).}))))))))....)))))))))))))))).).)))).,,||{,,,,(((,{{,...|||....,|||}.}},))}))),.}))}}}|||||.(((((.(((((((...(((,,.{{{..,(((.((,.,{.{((.....}})}},}}.))))})..,,.)))))))).)).))))),))))).......})))))))))).....((((((...)))))).)))))),.))))))))))))............((((....)))).))))))))).......{(((({......}))))}..)))))))))))..))))))))))))).)))))){|{{{{{..{{{......,,,,,.}}}.}))))})}.)))))...))))).))))))))))))(((((((.((((....(((((((.,{(,,....,.,,..,}),..)))))))...)))).))))))).......))))))......)))))))))))))))..))))..))))).),)}....))))))....))....)))))))).)))))(((((((,(...,{,|}}})))).},||,,}.)),...))))))..)))))))..}}))))))).}.))))....))))))))}|||,,.,.,..,,.,,|{{(({,{{|||(|,{,||,,||.,,))}.,|,||||,.|||.||||||||{|,..}}}}},........(((((((((........)))))))))((((((((((,..,))))))))))).,,}))))}||||......,},,.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001257135.2 NCBI
AUGAACCUCUGAAAACUGCCGGCAUCUGAGGUUUCCUCCAAGGCCCUCU… 3692 nt 0.5710
NM_002309.5 NCBI
AUGAACCUCUGAAAACUGCCGGCAUCUGAGGUUUCCUCCAAGGCCCUCU… 3871 nt 0.5709
Summary

The protein encoded by this gene is a pleiotropic cytokine with roles in several different systems. It is involved in the induction of hematopoietic differentiation in normal and myeloid leukemia cells, induction of neuronal cell differentiation, regulator of mesenchymal to epithelial conversion during kidney development, and may also have a role in immune tolerance at the maternal-fetal interface. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2012]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.