Basic Information

Symbol
LIFR
RNA class
mRNA
Alias
LIF Receptor Subunit Alpha Leukemia Inhibitory Factor Receptor CD118 Leukemia Inhibitory Factor Receptor Alpha LIF Receptor Alpha CD118 Antigen LIF-R LIF Receptor SJS2 STWS SWS
Location (GRCh38)
5:38474668-38608354
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001127671.2
Sequence length
10553.0 nt
GC content
0.3713

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2707.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2915.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3119.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001127671.2 NCBI
AGUCCCGGCUGGAGCGACUCGGCCGUGGCGGUGGCCGUUACCGUUGCCU… 10553 nt 0.3713
NM_001364297.2 NCBI
AUCAAACGCGUCCGGCAUACAGCGUAAACAUCUUCAGACCGUGAUUCUG… 10573 nt 0.3655
NM_001364298.2 NCBI
AUCAAACGCGUCCGGCAUACAGCGUAAACAUCUUCAGACCGUGAUUCUG… 10540 nt 0.3653
NM_002310.6 NCBI
AAAUCCUAACCCUCUCUCCCAGAACGUGUCUCUGCUGCAAGGCACCGGG… 10385 nt 0.3614
Summary

This gene encodes a protein that belongs to the type I cytokine receptor family. This protein combines with a high-affinity converter subunit, gp130, to form a receptor complex that mediates the action of the leukemia inhibitory factor, a polyfunctional cytokine that is involved in cellular differentiation, proliferation and survival in the adult and the embryo. Mutations in this gene cause Schwartz-Jampel syndrome type 2, a disease belonging to the group of the bent-bone dysplasias. A translocation that involves the promoter of this gene, t(5;8)(p13;q12) with the pleiomorphic adenoma gene 1, is associated with salivary gland pleiomorphic adenoma, a common type of benign epithelial tumor of the salivary gland. Multiple splice variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2018]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the LIFR is highly expressed in the EC2 subcluster of endothelial cells within the corpus cavernosum, as identified through single-cell transcriptome profiling [Zhao et al. DOI:10.1038/s41467-022-31950-9].