Basic Information

Symbol
LILRA2
RNA class
mRNA
Alias
Leukocyte Immunoglobulin Like Receptor A2 LIR-7 ILT1 LIR7 CD85h Leukocyte Immunoglobulin-Like Receptor, Subfamily A (With TM Domain), Member 2 Leukocyte Immunoglobulin-Like Receptor Subfamily A Member 2 Leukocyte Immunoglobulin-Like Receptor 7 CD85 Antigen-Like Family Member H Immunoglobulin-Like Transcript 1 Leucocyte Ig-Like Receptor A2 Leukocyte Immunoglobulin-Like Receptor Subfamily A Member 2 Soluble CD85h Antigen ILT-1
Location (GRCh38)
19:54572920-54590287
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001130917.3
Sequence length
4482.0 nt
GC content
0.4902

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1661.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1734.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1122.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((........((.(((((((.((.(((((((.((.(((.(((........))).))).))..))))).)).)))))))))))................(((((((....(((.(((((...))))))))..)))))))...(((.((((((((((((......((((((.....))))))...(((((((((...((((((((((((((((((.((((((...)).)))).))))..))))..(((((...((....(((....)))....))...)))))..)))))))......)))...)))))))))..(((((((((.((((((.................))))))...(((((.((..(((((((...................((((....))))))))))))))))))(((((((.((((...((.((.....))...))))))...)))))))((((....(((((((.((((.(.((((((.......)))))).).).)))))))))).))))......)))..))))))(((((((.(..(((((((((..(((((((...((.((............)).))..))))))).....(((((..(......)..))))).((((((((((((((.(((((...(((....)))..))))).)))))))............((((.(((((.....(((((((.....((((((..((((((.(((((((....((((.((......((((.(((((.((((((((((.((((((((((((((((((((.((..((((.((((.........((....))(((((.....)))))....((((((((.......)))))))).)))).))))..))......))))))((((((.((((((..........))))))......))))))))))).))))))))).))....(((......))).........((((((..((((...((((((.(((((.....((((.(((((....)))))..))))...((.(((...))).))(((((...)))))....((((((((...((.(......).))...))))))))...)))))))))))....))))....(((((......)))))(((((........))))).((((...((....))((((.....)))).)))).((((.((((((.(((((.((((..(((......))))))).)))))........(((((...((((.....))))......(((..((((((((((((((..((((.....(((.(((...((((((((......))))))))...))))))))))......((.((((.(((..((((((....((((((((.(((.((((..........(((((........))))).)))).)))..)))))))).....))))))....))).))))))..((((((((...(.......)...))))).))).........)))))).).)))))))..))).....))))).)))))).))))((((((((.((((((.......)).))))..)))))))))))))).....))))))))((((((...(((.(((.(((((.((.......))..))))).........((((.(((((((...(((((((((((.......((((.(((.......((((.(((......)))))))......)))))))((......))...............)).)))))))))..(((((......((((((...((((.(((.(((......(((((....)))))...))))))))))))))))....))))))))))))..)))).....))).))).))))))......((((.((((.(((......((((((..........))))))................))).)).)))))).((((.....))))................))))).)))).......(((((.((((.....(((..((((.....((((.........(((..(((((....)))))..)))((((((((((..(((...))).))))))))))....(((((..((((((((((((....(((....)))......))).)))))))(((....))).))..)))))..............((((((((((.......)).))).)))))......))))....))))..))).....)))))))))..)).))))......))))))).)))))).((((......))))...))))))...............(.(((((.......))))))...))))))).........((((((.((.((((((((..........)))).))))...))))))))..(((((..(((..............)))..)))))))))).)))))))))))..................((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((..(((((((..(((.(((((((((((((.((.((((((.(((.(((((((((((((..((((((((((((((((...((((((((....((((((((.(((((((((.(((((((((((((.((..((((.((((((.(((((((((((((.((.(((((((((((((.((((.(((((.((((((((((((((..((.(((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((......(((.......(((((.......)))))....(((((....))))).))).......)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))).))..)))))))))))))).))))).)))).))))))))))))).)).))))))))))))).)))))).))))..))))))))))))))).))))))))).))))))))))))))))...))))))))))))))))...))))))))))))).))).)))))).)).)))))))))))..)).)))..)))))))..))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))).((.((.(((((((......))...))))).)).))(((((.(((((((........))))))).)))))......(((...)))....)))))))))..).)))))))......)).)))).)))))).))).........((((.(((((((...(((.......)))....)))).))).))))...((((((((....)))))))).(((((((((....)))))))))...(((((((..(((((((............(((((........))))).....(((((((((((((((...(((((((((....(((....((((.....))))....)))........))))))))).))))).....................(((((((((((((((((((...((((((......(((.((..((((((((((..(((((((...(((((..((((((.....(((..(((((((.((.........))))))))))))...))))))..(((((((...)))))))(((.......)))...................)))))............((((....((((..((((((.............................(((........)))))))))..))))))))..........(((((((...((((....)))).....)))))))...........((((((......)))))))))))))....)))))....)))))..)))))............((((.(((((((..(((........)))..)).)).))).))))(((((((...(((........))))))))))...(((.....)))))))))...))))).......)))..))))).)))))).)))))))))).((........))...((((((((((....((((((...((((.....((((((((.........(((((...........))))).(((((((....)))))))..(((((((...))))))).............((((((..((((((((((....((((((.((((.......)))).)))))).....))))........)))))))))))).......)))))))).....)))).............)))))).....))))))).)))....((((((......................))))))))))))))))))))............((..((((((((...(((((..........)))))))))))))..))....))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((({((((((((,((((({{{{.(({(((((((.((.(((.(((........))).))).)),,))))|,||{}|||}}}||({.({((,,,.,,,....||||,||.{{{{{{{.((((({{|.,|((({.{||||,},...,,({{((,{(((((({......((((((.....))))))(((..(((.(((((.{(.....{(((,.(((((((((...((((((((((((((,{(({...||||(.((((.(((({..(((((((((.......,,{{{,{{((((((,....{,.....,{|||||{({|.{.,{,({{{({{{{,..{{{{{.........))))).....(((((.((,.{((((((...................((((....))))))))))))))))))|||||||,((((...((.((.....))...}})))).,,}))))))||||},}.(((((((.((((.(.((((((.......)))))).}.).))))))))))|||||{{{{{{||{{.,,,{(({{{...,...((((((((((..(((((((...((.((............}}.))..))))))){{{...))})))))))))).|((({,,...|.))))|,{,||}||||||||}}.}}})})))}}))),.))),},,...,,))))))))))))))))))....((((({{(,{{(((((.((((....)))).)}}})...),})..}))))}....({(({.,,{(({.{{.{(,(((((((((((((((((({{.((..((((.((({.......{{((....))|||{{.....}}},,....((((((((.......)))))))).)))).))))..)){{{{{.,,))))||||||,|}||||||........},}})),}}}).))))}}}}}}|,||||||||}.}}.}}..||,....))))}...{((.(((....))).)))})))),,,,),)..)))))}}))).))))))))))))))..)))))),))))).)))..))).,|||}}.|}}||{{{{(((,{{{(,,.{{,{......|,||.{,||}|||||...||||}|||||}{||.....,}},||||{,|,,,..)))))))||}|}},..,}}}}}|||||.{(((((,((({(({.(({.{{(((((........))))).....|}.}||||,}}.})).))}})}.,|,}})}||},,....{,.{,...(({{.....)))}......}}}.)}}))}|{{.,|,,,,}),)}}..}}))).)))),.((((((((......))))))))))))))}}...........})))))}((((((......((((,,.((......,,}}.,))))......)))))).........})))})))))))),{{|||}||,.,(({{{{,({{{{||||...,,,,,||}}||||},..,,))))}}.((((...{(,{((.((((((((((((((...((((((((((({.{(((........)))),|,{(((((((.((({{{,,,,...}),))))..)))))))|(((((.{{.|{{{({,,,.......,}}|||,|||,(((((,((.......},}}))))}..,,.....|{{(.((({((({,,(((((((((((......,((((.(((,,....,((((.(((......))))))}}..}}.})))}}}{{......||,....,......,,,}}.))))))))}.{{((,{......(({(((...(({{{(((.(({..,,..(((((....)))))...}))}}}}}||}}||||.,,.}}},}}}}}}}}..}}}}.||||{|{.{||,{{,({{{,.,,.,{((({{...{{|||....((((((.,.......,))))))................|||{||{|,||{|.{{{{...,,||},.............||||{({({{{|,..{{{.{(((((,......((((((....,,......{((({,..,}}}|{(..(((((....)))))..}},((((((((((,.,,....})}.))))))))))....{{(((,.,.||||{{{{((....{{{....}}}......}}}.}}})))}(((....)))..,..}})}},..............,,,{(((((.......)).)))),,)))}}),,,.,}..}}}))))..)))..,,})))),}}),.,}}}},|,,..,,})}}}}.})))||.,|||}}}},,,.}},||||}.}}}},.,........,}}}))}},{{,,.....}||||{.,|{{.,.,|,,,...,,}|||{{|,{|,((((((((.,......}.)))).))))...)))))}}}..(((((..(((..............)))..)))))|||||.....||.},.,,.....,,,......,,.((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((..(((((((..(((.(((((((((((((.((.((((((.(((.(((((((((((((..((((((((((((((((...((((((((....((((((((.(((((((((.((((((((((((({((..((((.((((((.(((((((((((((.((.(((((((((((((.((((.(((((.((((((((((((((,.((.(((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((......{{{...,...(((((.......)))))..,.(((((....))))).}}}.......)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))).)).,)))))))))))))).))))).)))).))))))))))))).)).))))))))))))).)))))).))))..))))))))))))))).))))))))).))))))))))))))))...)))))))))))))))).,.))))))))))))).))).)))))).)).)))))))))))..)).)))..)))))))..))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))),|{,((,({{{{((......))...})))).},.,,(((((.(((((((.,.....}))))))).)))))..,,,.}}},..,))))))).}))))))..))))..))))).))))))))).)))))}}}}...........((((.(((((((...{((.......)))....)))).))).))))...((((((((....)))))))).(((((((((....)))))))))...(((((({..(((((((............(((((,,,,,,,.}}}}}.....((((((((((,{(((,..{(({{{{((,,{{(({,,,.((((.....}))).,|||}|,|......,)))})))).}}}}}.......,,,.,,,......,||{|||((((({({{({.{||,||||{,......(((.((..((((((((((,.(((((((...(((((..((((((.....(((..(((((((.((.........))))))))))))...))))))..{((((((...))))))|(((.......))),..................))))}.....,,,....{{{{,...,{{{..{{{{{{,{{,..,.............,{|...||||{{........},,}}}}}}..,,,,,,....||,,,...(((((((...((((....)))).....)))))))...........((((((......)))))))))))))....)))))....)))))..)))))...,,,,,.,,,((((.(((((((..(((........)))..})}))},)).)))),{{{{{{...(((........)))}}})))),}||||,,,..|||||||||,,,})}),,})))}})},,.}}}}),,}}))),)))))))))).{{........}}...,{{{,{{(((....(((({{...{{{|...{{((({{{({{{.......(((((...........))))).(((((((....)))))))..(((((((...)))))))...,,,,......((((({..((((((((((....((((((.{(((.......)))).)))))).....))))........))))))}))))}.......)))))}}}....,))),..,,,........}})))}.....)))))))))))}.|||||((((......,|,..........,.......))))))))))))))........,,..((..((((((((,..{((((.,{....}}.)))))))))))))..))..,,},,,,,..}}},..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001130917.3 NCBI
CUCCGAGUGUCCACACCCUGUGCGUCUCUCUGUCCUGCCAGCACUGAGG… 4482 nt 0.4902
NM_001290270.1 NCBI
CACUGAGGGCUCAUCCAUCCGCAGAGCAGGGCAGUGGGAGGAGACGCCA… 1646 nt 0.5656
NM_001290271.2 NCBI
GCAUUUCCCCUUUUGAGACAGGGUCUCACUCUGUCACUGAGGCUGGAAU… 5097 nt 0.5011
NM_006866.4 NCBI
GCAUUUCCCCUUUUGAGACAGGGUCUCACUCUGUCACUGAGGCUGGAAU… 4971 nt 0.4965
Summary

This gene encodes a member of a family of immunoreceptors that are expressed predominantly on monocytes and B cells, and at lower levels on dendritic cells and natural killer cells. The encoded protein is an activating receptor that inhibits dendritic cell differentiation and antigen presentation and suppresses innate immune response. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found. This gene is located in a cluster of related genes on chromosome 19 and there is a pseudogene for this gene on chromosome 3. [provided by RefSeq, Mar 2014]

Forensic Context

A study in mice identified the LILRA2 as one of three genes (Lipg, Klrc2, Pclo) consistently differentially expressed in blood at all time points following scald-induced burn injury, indicating its association with burn injury progression [Wu et al. DOI:10.007/s10753-019-00984-5]. In human sepsis research, the LILRA2 was identified as a potential key gene for treatment and complication prevention in major burn injuries, and it was also found to be upregulated in monocytes from sepsis patients, suggesting a role for the LILR family in immune dysregulation [Ning et al. DOI:10.07/s10753-023-01803-8].