Basic Information
Symbol
LILRA5
RNA class
mRNA
Alias
Leukocyte Immunoglobulin Like Receptor A5
ILT11
LIR9
LILRB7
CD85f
CD85
Leukocyte Immunoglobulin-Like Receptor, Subfamily A (With TM Domain), Member 5
Leukocyte Immunoglobulin-Like Receptor Subfamily A Member 5
Leukocyte Immunoglobulin-Like Receptor 9
CD85 Antigen-Like Family Member F
Leucocyte Ig-Like Receptor A5
ILT-11
LIR-9
Leukocyte Immunoglobulin-Like Receptor, Subfamily B (With TM And ITIM Domains), Member 7
Leukocyte Immunoglobulin-Like Receptor Subfamily A Member 5 Soluble
Immunoglobulin-Like Transcript 11 Protein
Immunoglobulin-Like Transcript 11
Leukocyte Ig-Like Receptor 9
CD85f Antigen
Location (GRCh38)
19:54307041-54313166
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
MANE select
Transcript ID
NM_021250.4
Sequence length
1390.0 nt
GC content
0.5576
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-537.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-562.55 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
329.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((((((((((((.(((((((.((((((((((((((.((....))))))).(((((...........)))))))))).)))).)))))))...(((((..((((((((..((.....((((((((((..((((((((((((((....))))))).............((((((((((...((((.(((((....(.(..(((((((..((((((((((....(((.(((((...))))))))..)))))))...)))..)))))))..))))))).........((((((.(((.((((((.((((((.....((((((...((((.((((((..(((((((..(((.((.....)))))..).))))))..)))))).))))((....))....))))))....)))))).))........((((((.((...(((((........((((...((((.........))))..))))......(((((.......)))))....(((((((((((..((((((((..((((((..(((((.(((.(((((..((((((............((((((((.....(..(((((.((...)).)))))..)...((((.((........)).))))))))))))...((((((.((....(((((((((.((((((........))))))...))))))..))).(((((.(((.....))))))))...)).))))))...)))))).))))).))).)))))..)))).))..((......)).((((.((((....((..((((((.((((..((.(((..(((((....((((((.((((....))))))))))..(((((.....)))))..((((...........)))).))))).)))))....)))).))))))...))....))))...)))).))).))))).)))))))))))...))))).)).))))))(((((((....))))))))))).))))))))).....)))).))))))))))(((((.(((.((((((((((((((((...)))))....((((.((((((((......))))).))).))))(((((((.((.((((..((((((((....))).)).)))..)))).)).).)))))).....))))))))))).))).)))))..........................((((((((...))))))))(((((((.(((.(((((((((.((...)).)).)))))))...)))))))....)))...)))))))........)))))).))))......))..)))))))).)))))...))))))))))(((....)))((((....)))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{(((((((((((((((.(((((((.(((((((((((((({((....))))))).(((((........},,))))}))))).)))).))))))).,.((((,..((((((((..((.,...((((((((((..((((((((((((((....))))))).....(((((...((((((((((..{((((,(((((.{,,({(,,{{{{{{{,,|||||{((((....(((.{((((...)}||||||.,}}))})}...})}..)))))|}..,,}))))...||,...(((({(((((,,(((({.{|||{|.},,,||{|||}..((((.{(((((..(((((((..(((.{(.....)))))..),,)))))..)))))}.)))}||...{||{{..,,))))}...}}}}}}.}}..}}},,,|||{{|.,{..}|||||..}}}}}.||||,|.,,{{...{{.{,,||||{{|||,......(((((.......))))),,,}|((((((((((..((((((((.,({((((..(((((.(((.(((((..{(((({.....,......((((((((..,..(..(((((.((...)).)))))..)...((((,((......,.)).)))))))))))).,,,.((({.,...|||,.,,}}}}}((((((.,....}.))))))((.{({{(((,,....((((.{{{.,,,,}))})))))}))),)},}},...)))))).))))).))).)))))..)))).))..{{....,,|}.,,{{,((((,,..((.,((((((.((((.,((.(((..(((((,,..((((({{((((....))))))))))..(((((.....)))))..((({...........}))).))))).)))}).,,.)))).)))))).,.)).,,.))))...,}}}.))).))))).))))))))))}...}))))},)}}|||||(((((((....)))))))||||.,,))))},}.....)))}.)))))))))){,|||}|{,.(((((((((({((({(,..}}}}}....,|((,{({(((((......}}}}}.}|}|},|{(((((((.((.{(((..{{{{{(({....))).)).)))..)))}.)).),)}}))),....,}}}))))))).}}},))}}}........................,,((((((((...)))))))),((((((.(((.(((((((((.({...}).)).)))))))...)))))))...,)}}...))))))).,......)))))).))))......))..)))))))).})))).}.))))))))))(((....)))|(({....}))}.)))))}
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GCAUUUCUCCUCUGUGCUCAUUGCCACAUGCAGCUCAGCCUGGGCUACA… | 1390 nt | 0.5576 | |
| GCAUUUCUCCUCUGUGCUCAUUGCCACAUGCAGCUCAGCCUGGGCUACA… | 1108 nt | 0.5785 | |
| GCAUUUCUCCUCUGUGCUCAUUGCCACAUGCAGCUCAGCCUGGGCUACA… | 1354 nt | 0.5532 | |
| GCAUUUCUCCUCUGUGCUCAUUGCCACAUGCAGCUCAGCCUGGGCUACA… | 1072 nt | 0.5737 |
Summary
The protein encoded by this gene is a member of the leukocyte immunoglobulin-like receptor (LIR) family. LIR family members are known to have activating and inibitory functions in leukocytes. Crosslink of this receptor protein on the surface of monocytes has been shown to induce calcium flux and secretion of several proinflammatory cytokines, which suggests the roles of this protein in triggering innate immune responses. This gene is one of the leukocyte receptor genes that form a gene cluster on the chromosomal region 19q13.4. Four alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in humans and mice demonstrated that the LILRA5 is a key diagnostic marker for sepsis, identified through machine learning algorithms and validated across multiple external datasets and clinical samples with high AUC values [Ning et al. DOI:10.07/s10753-023-01803-8].