Basic Information

Symbol
LILRB2
RNA class
mRNA
Alias
Leukocyte Immunoglobulin Like Receptor B2 MIR-10 LIR-2 MIR10 ILT4 LIR2 CD85d Leukocyte Immunoglobulin-Like Receptor, Subfamily B (With TM And ITIM Domains), Member 2 Leukocyte Immunoglobulin-Like Receptor Subfamily B Member 2 Monocyte/Macrophage Immunoglobulin-Like Receptor 10 CD85 Antigen-Like Family Member D Myeloid Inhibitory Receptor 10 Leucocyte Ig-Like Receptor B2 ILT-4 Leukocyte Immunoglobulin-Like Receptor 2 Immunoglobulin-Like Transcript 4 Ig-Like Transcript 4 CD85d Antigen
Location (GRCh38)
19:54273812-54281184
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Individual identification Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001080978.4
Sequence length
2863.0 nt
GC content
0.5355

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-955.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1010.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 817.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.((((((.(((..((((((..............))).)))...))))))))).)))))))..(((.((((.((((((((.((.((((((.(((.(.((((((.........((((((...(((((((((((.....(((((((..(((((.(((((.((((((........))...))))(((((((.....((((.......))))(((.(((((......)))))))).((((((.((((((((...(((.((..((((((..........((((((.((((.((((((.(((((......((((.((..((((((......)).))))..)).)))).((((.((..((.(((((((((.((((..((((((((((((.......(((((((....(((((((((..............((((((..(.(((((.(((((.(((((.........)))))...((((((((.....((((((.......))))))(.((((((....)))))).)..........(((.(((((.(.(((.(((..................))).))).)))))))))))))))))(((((.(((.(.(((.(((...))))))..).))))))))..)))).).))))).))))))))))))))))....((((((((((..........(((.(((......)))...)))...((((((....)))))).))))))))))(((((((((((((.......)))).)).)))).))))))))))...(((........)))))))))))))))))))..((((...)))).))))))).))))..)))))).((((((((...)))).)))).((((..((((((.((((((.((((((((((..((((((..(((((......))).)).)))))).....))))))))))))))))..))))))..))))((((...((((...))))...)))))))))...)))))))))).))))))..((((((..........))))))))))))..)))))))))..)))).)))).)).........(((.......))))))))))))))).)))))...((((.(....)))))...(((((....)))))......)))))))..))))))...((((((((((..(((((...((((((((((((((.(((.(((.....(((((((((....)))).)))))....))).))))))))))....)))((((((((.((((((((((....(((...(((((..((...................(((((.....((((((.((((((.((((.(((((((...((((.(.(((.((((..(((((.......................)))))..))))...))).)))))))).))).).)))).))))))....))))))...)))))(((((....((..(((((...((((..((((((((((((.......)))))........))))))).........))))..))))).))....)))))))..))))))))....))).)).))))).....))))))))((..((((.((((.(((((.((.((((..(((......))).((((.....((((........))))((...((((((((((((.....(((((((..(((((((.......))))))).......)))))))))))))).)))))...))......)))))))).))..........((((..(((.....))).))))..))))).)))).))))..)).)))).))))))))))).)))))))))....)))))))))))).).)))))))))..))..)))..))))).(((((((......))))..))).((((......)))).....)))).)))((((((((((..(((..((.(((.........))).))..)))..((((.((((...((((((((...((...))....)))))).)).....)))))))).((..((((.............((((.....))))..............))))..)))))))))))).((..(((((..((.((.....(((((((((...........................((((((((....((((((............((((.........))))......)))))).......))))))))......((((((((((.(((((((((((((((((..........................................................((((..((..((.((((((((((.((....((.((((.......))))..))..(((((((...................))))))).........(((((..(((...((.....))......))).))))).))))))))))))..((((.(((((.......(((((...(((...........)))..)))))........))))).)))).(((...(((((((....))))))).))).((.....)).)).))..))))((((((((...((((.((.....(((.......(((((...(((...........)))....)))))......)))(((.((..((((....))))..)).)))...........(((...(((((...)))))))).........)).))))...)))))))).......)))))).))))))).)))).))))).)))))......)))))))))....)).)).)))))..))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.((((((.(((..((((({..............))).)))...))))))))).)))))))..,((((((((..,((((((((.((((((.(((,{,((((((.,,{{{,.,({,{{{.,.||(((((((({,.,,{(((({(({.,.{,((({{{{.{{.||,{{{{{,||{(((,((((({((.{.,....,,.,,,}}.}},})}}.}}}}}}.}}}}|.,,|||{|},}|||{||{{,{{(((((((..((({(((.(((((..(((((.(((((((...)))))))(({.,,,.}})}}.|.,,.....))))))))))))).,{{{..,,.,,,,}||{,,((..(,{(((((((((.((((..{(((((((((((.......(((,(({,{{.,{,,,{{,,..,,.}}}}}}}}{(((,.({{(.,,,,}}}||||,,,,((,{,.,,.{{||||,.{,((((((((....,((((((.......))))))|.((((((....)))))).,..........(((.(((((.(.(((.(((..................))).))).)))))))))))))))))|||,,}|||}|.{||.|||,,.}},}}}.{|.}||||||,..||||{{{{||||{{||,||,||{|||,,.....((((((((((..........,{(.(((......)))...}}},..((((((....)))))).)))))))))).((((({,...|.)))),..,)))})),)))))).))))))))}}.,,..}})}))..}}))))))))))))))))..((((...)))).))))))).))))..)))})).((((((((...))))},))).......,})))..)))))))}|{(((((((|,{(((((.,(((({.....,)}|,||.}|}}}|.,|,,|}}}}))))|((((((((((((...(((((((((..{({..{{...(((((....))))).)}(((((...)))))(((((.,,((((((..........,}))}},}}.))))),,,.....(((((((((((((((.(....(((.......)))...,.))),.})))).))))))),))}.}))))}.....}))),...))))))))))))}}|||||{,}}}},,...((((((((((..(((((...((((((((((((((.(((.(((...{{(((((((((....)))))))))}....))).)))))))))}...,)))((((((((..(((({{(((,,..{,{...(((({..,{..,................(((((.,...((((((,((((((.((((.(((((((...((((.{,{{(.((((..(((((.......................)))))..))))...))).)))))))).))).).)))).))))))..,.)))))),,.)))))((({{....,,(((((((...(((....|}|...||.))})).{,,,||||,,.{{{,{|||,.,,..,}},..,))))..})))}.))}...))))))),})))))})}....}))})),.),))}}...)))))))){{..{{{{.(({{,((({(.....,{{,.{,,.,||,.}||||||....,.||||,,.|||..,||},}...((((((((((((.....(((((((,.(((((((,{....}))))))).,.....))))))))))))))}}))))..,|||||..,||}|||},{{{.....))).,{|||..|||..,,.},}.)))).,)}})).)))).))))..)),)))).))))))))))).)))},)}}}...,)),))))})))).)}))))))))),.}},,}|,.{||}|,.(({{(((......))))})}}}.{(((......)))}.,,}}}}||{|,},,}))}.,,,..(((..{{,|||.........}}}.)).})))..)))))))}.....)))))))},((,{..{{{((.((((((..{{{{.,||.}}}}}},,||}|||...}}..}}....,|||.}}}}))))...}|}............{{|,.((((({((((((.,({(((.{(,.,,}|,|,{((((((({......................,,...{(((((({.{{.|{(((({...,,,...,,|}||....,},....,,......||}}}},,,..,})))))))}..,}}.(((({(((((.((({{((((({((((((......,{,......,.},...,,,...........,,...................,{(((..((..{{.((((((((((.{{....{{.{{{{.......,,,,..||..(((((((...................))))))}.........((({{..||,...{{.....}}....,}}||.,,})).}}))))))))))..((((.(((((.......(((((...(((...........)))..)))))........))))).)))).(((...(((((((....))))))).))).((.....)).},.))..)))|((((((((...((({.,,.....(((,......(((((...(((,..........)))....)))))......|||(((...,,|||}...}))),||||,,....,,,,,.,..(((,..{((((...)))))))).......,,)),)))).,,)))))))}},.,,,.}})))))))))))))))))})})))})))))......})))))))}.....,..)))))))..)))))..)))..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001080978.4 NCBI
GCAUUUCUCCUCUGUGCUCACUGCCACACACAGCUCAACCUGGACAGCA… 2863 nt 0.5355
NM_001278403.3 NCBI
GGGGAAGCCACUGCUACCCUCAUCAGGAAGGGCAGACACAAGAAGCACC… 2793 nt 0.5335
NM_001278404.3 NCBI
GCAUUUCUCCUCUGUGCUCACUGCCACACACAGCUCAACCUGGACAGCA… 2715 nt 0.5300
NM_001278405.2 NCBI
CACCGAGGGCUCAUCCAUCCGCAGAGCAGGGCAGUGGGAGGAGACGCCA… 2646 nt 0.5276
NM_001278406.2 NCBI
CACCGAGGGCUCAUCCAUCCGCAGAGCAGGGCAGUGGGAGGAGACGCCA… 1422 nt 0.6069
NM_005874.5 NCBI
GCAUUUCUCCUCUGUGCUCACUGCCACACACAGCUCAACCUGGACAGCA… 2866 nt 0.5356
Summary

This gene is a member of the leukocyte immunoglobulin-like receptor (LIR) family, which is found in a gene cluster at chromosomal region 19q13.4. The encoded protein belongs to the subfamily B class of LIR receptors which contain two or four extracellular immunoglobulin domains, a transmembrane domain, and two to four cytoplasmic immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motifs (ITIMs). The receptor is expressed on immune cells where it binds to MHC class I molecules on antigen-presenting cells and transduces a negative signal that inhibits stimulation of an immune response. It is thought to control inflammatory responses and cytotoxicity to help focus the immune response and limit autoreactivity. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans and mice identified the LILRB2 as a key diagnostic marker for sepsis, demonstrating robust diagnostic performance with AUC values up to 0.980 in external validation datasets and confirmed by qRT-PCR in clinical samples [Ning et al. DOI:10.07/s10753-023-01803-8]. A study in humans demonstrated that the LILRB2 regulates spermatogenesis and male reproductivity by targeting Rad51 [Doghish et al. DOI:10.1007/s00210-024-03594-7]. In a separate forensic investigation, differential expression of the LILRB2 was observed in blood samples from monozygotic twin pairs, supporting its potential role in distinguishing genetically identical individuals [Xiao et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2019.05.003].