Basic Information

Symbol
LIN28A
RNA class
mRNA
Alias
Lin-28 RNA Binding Posttranscriptional Regulator A ZCCHC1 CSDD1 Lin-28 Homolog A LIN-28 LIN28 Zinc Finger CCHC Domain-Containing Protein 1 Protein Lin-28 Homolog A FLJ12457 Lin-28A Zinc Finger, CCHC Domain Containing 1 Lin-28 Homolog (C. Elegans) RNA-Binding Protein LIN-28
Location (GRCh38)
1:26410817-26429728
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Forensic tag(s)
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HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024674.6
Sequence length
3975.0 nt
GC content
0.4840

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1574.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1644.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 680.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_024674.6 NCBI
CCUUUGCCUUCGGACUUCUCCGGGGCCAGCAGCCGCCCGACCAGGGGCC… 3975 nt 0.4840
Summary

This gene encodes a LIN-28 family RNA-binding protein that acts as a posttranscriptional regulator of genes involved in developmental timing and self-renewal in embryonic stem cells. The encoded protein functions through direct interaction with target mRNAs and by disrupting the maturation of certain miRNAs involved in embryonic development. This protein prevents the terminal processing of the LET7 family of microRNAs which are major regulators of cellular growth and differentiation. Aberrant expression of this gene is associated with cancer progression in multiple tissues. [provided by RefSeq, Sep 2015]

Forensic Context

A study in *C. elegans* demonstrated that the LIN28A is a conserved RNA-binding protein specifying early larval fates [Fielenbach et al. DOI:10.1016/j.devcel.2007.01.018].