Basic Information

Symbol
LIN7A
RNA class
mRNA
Alias
Lin-7 Cell Polarity Scaffold A MALS-1 TIP-33 VELI1 Lin-7 Homolog A, Crumbs Cell Polarity Complex Component Tax Interaction Protein 33 LIN-7A Mammalian Lin-Seven Protein 1 Vertebrate LIN7 Homolog 1 Protein Lin-7 Homolog A MALS1 Lin-7 Homolog A (C. Elegans) Vertebrate Lin-7 Homolog 1 Mammalian LIN-7 1 Lin-7A HLin-7 Veli-1 LIN7
Location (GRCh38)
12:80792520-80937934
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004664.4
Sequence length
6121.0 nt
GC content
0.3669

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1454.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1575.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1710.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001324423.2 NCBI
GUCACUUCGGCUCCCACGGCAGACAUGGCGACAUUGACAGUGGUCCAGC… 5775 nt 0.3571
NM_004664.4 NCBI
AGUCGCUCUCGGAUACCUGCUCAGCUCCGCACCGCAACUGAAGAUCUGC… 6121 nt 0.3669
Summary

The protein encoded by this gene is involved in generating and maintaining the asymmetric distribution of channels and receptors at the cell membrane. The encoded protein also is required for the localization of some specific channels and can be part of a protein complex that couples synaptic vesicle exocytosis to cell adhesion in the brain. [provided by RefSeq, May 2016]

Forensic Context

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