Basic Information

Symbol
LIPH
RNA class
mRNA
Alias
Lipase H PLA1B LPDLR MPA-PLA1 Membrane-Associated Phosphatidic Acid-Selective Phospholipase A1-Alpha LPD Lipase-Related Protein Phospholipase A1 Member B Phospholipase A(1) Lipase, Member H Lipase Member H MPA-PLA1 Alpha MPA-PLA1alpha Membrane-Bound Phosphatidic Acid-Selective Phospholipase A1 EC 3.1.1.- EC 3.1.1.3 EC 3.1.1 MPAPLA1 ARWH2 HYPT7 LAH2 AH
Location (GRCh38)
3:185506262-185552617
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_139248.3
Sequence length
4001.0 nt
GC content
0.4611

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1252.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1328.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 978.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((.....((.(((((..(((((((..(((.......((((((((((((.....((....))...((....(((((....)))))....))...........))))))))).)))(((((((.((((.(((((((.((((.((.(((..(((.......)))))).)).)))).(((((((((((((((((((((((.............(((((.(((.((((......((((((((....)).)).))))........))))))).)).))).............))))))))((((..((......))..))))(((.......)))...((.((((..((((((((....)))).((.(((.....))).))............((((......))))..))))..)))).))..((((((.(((..(((....)))..))).))))))........(((((((.(((.((((.((.((((.......(((((((((.((((....))))..))))).....))))(((((...)))))..((((.(........).))))(((..((.((((((((((((...((((((((((((((......(((((((((((.((((((..((((....(((((((....)).)))))....))))...((....))...................)))))).))((.((((.(((((.((((.........)))).))))).)))).))..((((..((((....(((((.(((..((((((.....((((((((((..(((((.((((((((.............((((((((....((((.........((((......)))).........))))..))))))))........(((((.((...((((((.(((.(((((((.((((...))))))))))).))))).)))).)))))))..)))).))))............(((((((((.((((((.((..((((......((((.(.((.((...((((((....))))))......)).))).))))......))))....)).)))))).((((((.(((....)))..)))))).......((((.........)))).....)))))))))...((((((.....(((((((.....(((((((((((...((((........((.((((..........))))))........((((((....))))))..((((((.....))))))))))...)))).))...)))))....)).)))))((((((((........(((...((((((.(((.(((..((((((.(((..((.(((....))))).))).))))))..))).))))))))))))..))))))))..)))))).....)))))..))))))))))......(((((.(((((((((((....))))))...((((.......)))).........(((........)))....((((((.(((((((...............(((((((...))))))).....((((((((.(....).))))))))((.((((((...)))))).))........))))))).)).))))..............))))))))))((((.......))))(((((((((((((((((((.((((((((((((....)))).))))))))...((((((((((.((((.((..(((........((((((((((..(((((.(((......))))))))...))))))..)))).......)))..))))))...))))))))))..(((((((((.....((((.....))))............((((((..........)))))).....))).)))))).....(((((..((((((.((((((((((((....(((((((..((((((....)))))))))))))...........(((((((((((.(((((((((......)))))))))((((((.(((.(((...))).)))))))))(((((((((.(((.((((((.......))))))...(((.((((((((((.((..((((.....))))..))))))))))))..)))((((..((((.(((((((((..((((((....(((((((..(((((((((((((((.(((((.(((((((....)))..................((((..(((....)))..)))).((((.((((((((((((.(.(((.(((((.(.(((((((.(((((((((.(....((((((((...))))))))((((((.....((((..........(((((((.....)))))))..(((((((((((((..(((.((...((((((...))))))....)).)))..))))...)))))))))..................))))....))))))......(((((....((.(((((((.......))))))).))......)))))....((((.........))))....).)))))))))(((...(((..((((....))))..))).)))....)))))))...(((((((.((((((..((...(((((..((((((((((...((((((..((.((((...(((....)))((((((((((((((((..(((.((((((((.(.(((....(((.(((.(((.....))).)))))))))).))))).)))..)))..))).(((((.((((((((((.......)))))))))).)))))...(((((........)).)))(((((........)))))....((((.........)))).....)))))))))))))....(((((((((...(((((((((((....))))..)).)))))....)))).))))).....)))).))..)))))))))))))(((((....)))))((((((((......(((....)))......)))))))).....)))..)))))))..)))))).)))).)))..........).)))))))).).)))))))))))).))))...))))...))))).)))...(.((((((......(((....)))......)))))))....(((((((.(((.((........)).))))))))))...((((((.(((((((....((((......))))...)))..))))..))))))..((.((((((((((((((..((.....))..))).))))))))))).)))))))).).))))))))))))))))))..)))))).))))))).))))...))).)))))))))(((((.(.(((...)))))))))............................((((.(((...))).))))..((((((((.(((((((((((((.((....)))).)))))))..))))))))...)))))))))))..)))).......)))))))))...))).)...)))))..)))))......)))))))).))))))).))))...))))))..)))))))).......)))))))).....((.((((((((((((...(((.(((......))).)))...)))))))))).)).)))))))))))))))))...(((((...(((((.((..((((((.(((((((......))))))).)....(((((..(((...((((.....))))))).)))))))))))))))))...)))))............(((......)))))).)))))...))))).)))))))))))).....)))))).)))).))))))))))....)))))))))).))))).......(((.....))).((.....)).)))))))...)))))))))))))).)))))))))))).)).....)))((((....))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
......{((,{,..((,(((({..(((((((,.(({......,{{{{((((((((.....{{..,,||{.,{{....(((((....))}}}...,.,.,|,,,,,...})))))))}.)),{|{||||.{{{{.{{{{{{{.((((.((.(((..(((.......)))))).)).)))).(((((((((((((((,(((((((.......{((...((((({(((.((((......((((((((....)).)).)))){{{.....)))},))}),}),).,})}}}..}}}.)))))))|((((..((......))..))))|,,.......,,,..,((.((((..((((((((....)))}.{(.(((.....))).))..,,...,,,..{{|{,,,,},}}}}.,})))..)))).}}{{((((,(,,(({{(,,..,})))..))),)),,},....,{,.(((((((.(((.((((.((.((((.......(((((((((.((((....))))..))))).....)))),,,{(,,{|||))|}|{{(,{,,.....,},}))}(((..{(.((((((((((((.{((((((((((((((((((..((({,((({(((,(({(((({((,,,{,{((,,{{(,{{{{|.,||||.,{{|,,,.,,,(({,.{|{{.{{{,.......,.,..||||||.,}{{,((((.,(((({((.....}},,.}))))})).}}}))))})},....(,(((((....((..({....(((({{......}))))).,))..))....))))).)|,{,,.......)))))|||,|||}.}}.,..|,,,,|,|,|}..}}},||}}.,....)))})}.,,.|||}}}}.},,,.,,(((((,({,,.((((((.(((.(((((((.((((...))))))))))).)))))},)))}),))))),,||,,,}}},,,....}}))))|((((((((,((((((.{(..((((.....{(({....||,||,,.((((((....))))))..,{.{{{{{|...}))))}.,.))))..,.,,.)))))}.((((((.(((....)))..)))))).......((((.........)))).....))))))))}...)))))...,,|(((((((.....(((((((((((...((((,...,,..,,.{{{,..........}}}}|}........((((((....))))))..{(((((.....))))))))))...)))).))...)))))....)))))))))))...))))))))))))))},)))},.{({(,(((,{(({(((,,{{.,({(,(({.,.|||}|,}},.})))))},))).)))).,,||||.,.}},,,})},))}}{((((.((,,.....,.)).)))))...........(((.((((((((((..(({(((({,(((((((((((.((((({(((....((,{{((,.......{{((.,((((((((((..{{{{{,,,.....(((((((...)))))))..,..{(((((({.{....|.}))))))}{{.((((((...)))))),||,,{{{...,|,,}}},,..)))),,........,.{{{{{{,.{({,{,{|}}..,,})))}{({{(((((((((((((((.((((((((((((....)))).))))))))...((((((((((.{{(,{((,.(((........((((((((((..((((({(((......))))))))...)))))}..)))).......))).,))})))}..))))))))))..(((((((({.....((((.....))))............((((((..........)))))),....))).)))))).....(((((..((((({.((((((((((((,,,,((((,{{..{|||||,...}}}}}}|||||||{...|||||},|||||||{{{,,(((((((((......)))))))))|(((((.(((.{{,...,}}.))))))))|(((((((((.{({.((((({,......})))))...|||.((((((((({{((..((((.....))))..))))))))))))..,}|((((..((((.(((((((((..((((((,..,(((((((..{(((((((({,.(((.(((((.(((({{{,,..,{|,,................((((..(((....)))..)))).((((.((((((((((((..((((..(((((({.((({{,.(((((((((.(....((((((((...))))))))((((((.....((((.....,,,..{{{((((.....)))))}}..(((((((((((((..(((.((...((((((...))))))....)).)))..))))...)))))))))..................))))....))))))......(((((....,(.(((((((.......))))))).})......)))))....,{{{...,,,...},)),,..).)))))))}|((((..{{,...,,}}}}||...{{{{|{,|},|||}}},{|{((((({...,((((((..............))))))|((((,.{(((((,..{{((((({..(((((.(((((......(((((......)))))(((({,((((((({........,.,.)))}...)))))))).))))).)))))...))))))....,.(((((.((((((((((.......)))))))))).)))))}}...))))))))))}.(({..(((((........)))))..}})....(((((((..({.........}},,)))))},...,((((((((...(((((((((((....))))..)).)))))....)))),})))))))}}}))).,},...)))))))}))))))),.)))).,{,((((((((......(((....)))......)))))))).,,...............(((((.((((({..,.......}..}))))))))))...)))))))))))).)))),,,)}}),,,))))).)))...{.((((((......(((....)))......))))))}....(((((((.({(.{{........)).)))))))))){{{((((...(((((,(,....,,,.}.}}})),..)))))}}},}}...,,,,|{(((.((((((((((((((..((.....))..))).))))))))))).)))))))).}.))))}))))))))))))),.)))))).))))))).))))}..))).))))))))){((((.(.(((...)))))))))............................{(((.(((...))).))))..((((((((.(((((((((((((.(,....}))).)))))))..))))))))...))))}}}}|||..,,,,}}}....))))))))}...))).}...)))))..)))))......)))))))),,)))))).})},...||.((({..{(({...})))}}}}})}}}}}..,},||.{(({{(((((((...(((.((({....,))).))}..,))))))))))})}}))}..))),.,..))))))),))))))))))),...}))),})))))))))))))....))))))).,,..,,(((({..,{((((((.....)))))))....))))}..|||,,,...})).{(((((...})))))..,,,.})))}}})))).)))..))))).)))))))))))).....)))))).)))).)))))))))).,},)))))))))).)))))......,|{,.}}},}}}.{{...,.)),)))))}},,,))}}})}}))}}}}.}))))))))))).)}.....}}|((((....))))}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_139248.3 NCBI
ACCACACCUCUGAGUCGUCUGAGCUCACUGUGAGCAAAAUCCCACAGUG… 4001 nt 0.4611
Summary

This gene encodes a membrane-bound member of the mammalian triglyceride lipase family. It catalyzes the production of 2-acyl lysophosphatidic acid (LPA), which is a lipid mediator with diverse biological properties that include platelet aggregation, smooth muscle contraction, and stimulation of cell proliferation and motility. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.