Basic Information

Symbol
LMNB1
RNA class
mRNA
Alias
Lamin B1 Lamin-B1 LMN2 LMNB ADLDAT MCPH26 ADLD LMN
Location (GRCh38)
5:126776623-126837232
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005573.4
Sequence length
2890.0 nt
GC content
0.4779

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-893.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -950.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1005.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001198557.2 NCBI
GCUCCGUGCAGCCUGAGAGGAAACAAAGUGCUGCGAGCAGGAGACGGCG… 2267 nt 0.4217
NM_005573.4 NCBI
GCUCCGUGCAGCCUGAGAGGAAACAAAGUGCUGCGAGCAGGAGACGGCG… 2890 nt 0.4779
Summary

This gene encodes one of the two B-type lamin proteins and is a component of the nuclear lamina. A duplication of this gene is associated with autosomal dominant adult-onset leukodystrophy (ADLD). Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Dec 2015]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the LMNB1 was upregulated in spleen leukocytes as part of a common early transcriptional response across three models of systemic inflammation and injury (trauma/hemorrhage, burn, and LPS infusion) [Brownstein et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00213.2005]. This upregulation was identified via microarray analysis and was associated with pathways involved in cell death, indicating its role as a molecular marker of early inflammatory leukocyte activation following diverse injuries.