Basic Information

Symbol
ABHD5
RNA class
mRNA
Alias
Abhydrolase Domain Containing 5, Lysophosphatidic Acid Acyltransferase NCIE2 1-Acylglycerol-3-Phosphate O-Acyltransferase ABHD5 Abhydrolase Domain-Containing Protein 5 Lipid Droplet-Binding Protein CGI-58 EC 2.3.1.51 CGI-58 Abhydrolase Domain Containing 5 CGI58 IECN2
Location (GRCh38)
3:43690108-43734371
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation Individual identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016006.6
Sequence length
5298.0 nt
GC content
0.3700

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1368.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1471.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1454.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001355186.2 NCBI
AGUCGGCCUGUCAGCCGGCUUCGAGAUAAGUCCCGGCGCUUGCGCGGCG… 1456 nt 0.4801
NM_001365649.1 NCBI
GGGUUAGGGCCCAGCGGGCAGCACCAAGGAGUCGCCGCCCGCCUGGCGA… 5608 nt 0.3928
NM_001365650.1 NCBI
AGUGCGCGGAAGACGCAUGCGCUGGCGGCCUGCGCCGCCUUAAGUGCCG… 5179 nt 0.3723
NM_016006.6 NCBI
AGUCGGCCUGUCAGCCGGCUUCGAGAUAAGUCCCGGCGCUUGCGCGGCG… 5298 nt 0.3700
Summary

The protein encoded by this gene belongs to a large family of proteins defined by an alpha/beta hydrolase fold, and contains three sequence motifs that correspond to a catalytic triad found in the esterase/lipase/thioesterase subfamily. It differs from other members of this subfamily in that its putative catalytic triad contains an asparagine instead of the serine residue. Mutations in this gene have been associated with Chanarin-Dorfman syndrome, a triglyceride storage disease with impaired long-chain fatty acid oxidation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans established a targeted RNA sequencing protocol for predicting the time-of-day of bloodstain deposition, where the ABHD5 was included as one of 69 candidate mRNA markers [Gosch et al. DOI:10.1101/2025.02.03.636230]. In the final penalised regression model, the coefficient for the ABHD5 was zero in both sine and cosine components, indicating it did not contribute to the final predictive model [Gosch et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103287]. A study in humans demonstrated that adipose tissue ABHD5 (at-ABHD5) mRNA expression was positively correlated with adipose tissue ANGPTL4 mRNA expression in monozygotic twins [Robciuc et al. DOI:10.1194/jlr.P015867].