Basic Information

Symbol
APLN
RNA class
mRNA
Alias
Apelin XNPEP2 APJ Endogenous Ligand APEL Apelin, AGTRL1 Ligand AGTRL1 Ligand
Location (GRCh38)
X:129645259-129654959
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017413.5
Sequence length
3224.0 nt
GC content
0.5592

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1294.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1351.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 858.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_017413.5 NCBI
GAGCAUUCUCUCUGGCAGCCGGGGUCACGGGCAGUUGCAGCCGCGGCCG… 3224 nt 0.5592
Summary

This gene encodes a peptide that functions as an endogenous ligand for the G-protein coupled apelin receptor. The encoded preproprotein is proteolytically processed into biologically active C-terminal peptide fragments. These peptide fragments activate different tissue specific signaling pathways that regulate diverse biological functions including fluid homeostasis, cardiovascular function and insulin secretion. This protein also functions as a coreceptor for the human immunodeficiency virus 1. [provided by RefSeq, Feb 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the APLN and its receptor APJ are differentially expressed in models of vasculogenic erectile dysfunction, with up-regulation in acute cavernous ischemia and down-regulation in chronic hypercholesterolemic and diabetic models [Kwon et al. DOI:10.1111/jsm.12158].