Basic Information

Symbol
LMTK2
RNA class
mRNA
Alias
Lemur Tyrosine Kinase 2 AATYK2 KPI2 LMR2 BREK KIAA1079 PPP1R100 KPI-2 Cprk Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 100 Apoptosis-Associated Tyrosine Kinase 2 Serine/Threonine-Protein Kinase LMTK2 Serine/Threonine-Protein Kinase KPI-2 Kinase/Phosphatase/Inhibitor 2 CDK5/P35-Regulated Kinase Brain-Enriched Kinase EC 2.7.11.1 HBREK Cyclin-Dependent Kinase 5/P35-Regulated Kinase EC 2.7.11 CPRK
Location (GRCh38)
7:98106860-98209638
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014916.4
Sequence length
8974.0 nt
GC content
0.5148

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3160.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3325.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2221.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_014916.4 NCBI
GUCACAUGACGCAGCCCAUCAUGGCGGCGGGAGCGCGGCUUCCCAGGCC… 8974 nt 0.5148
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the protein kinase superfamily and the protein tyrosine kinase family. It contains N-terminal transmembrane helices and a long C-terminal cytoplasmic tail with serine/threonine/tyrosine kinase activity. This protein interacts with several other proteins, such as Inhibitor-2 (Inh2), protein phosphatase-1 (PP1C), p35, and myosin VI. It phosporylates other proteins, and is itself also phosporylated when interacting with cyclin-dependent kinase 5 (cdk5)/p35 complex. This protein involves in nerve growth factor (NGF)-TrkA signalling, and also plays a critical role in endosomal membrane trafficking. Mouse studies suggested an essential role of this protein in spermatogenesis. [provided by RefSeq, Oct 2009]

Forensic Context

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