Basic Information

Symbol
LMTK3
RNA class
mRNA
Alias
Lemur Tyrosine Kinase 3 TYKLM3 KIAA1883 PPP1R101 AATYK3 LMR3 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 101 Serine/Threonine-Protein Kinase LMTK3 EC 2.7.11.1
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_001388485.1
Sequence length
5144.0 nt
GC content
0.7049

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2597.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2675.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1102.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((..(((((..((.(((((((((((.((((.((.(...((((((((((((.((((.(((..(((((....(((((((((((((...(((..........)))..))))))))))))).((((.((...((((...(((((.(((((((.(((((((..((((.(((.((((.......(((((((((..(((((.........))))).)))))))))....................((((((........))))...)).)))))))))))...))))))).)))))(((((((.(((((((.(((.((....)).))).(((((((.....(((((..((((..((((((....((((.(((((...(((((.((((((.((((((.(...((((....)))).....(((((((((((((..((.(((...((((..((((((((((((.(((.(((.((.....(.((.(..(((.(((((((.((.((((((((((....))))))....)))).)).))))))).)))..))).)..))))).))).))))(((((((((((((.(((((((...((((......(((((((..(((((((..(((....))).((((..(((((((...(((((((.((.(((((.((.((....)))).))))).)).))))))).(((..((((....(.(((((.....))))).)...)))))))))))))).))))))))))).(((.......)))))))))).((.(((..(((....)))..))).))..((((((((((((.((((...(((.........))).)))).))))...)).))))))(((((((((....)))))))))((((...........)))).(((((((((((...((...........)).....(((((.....))))).(((...((((.......)))).)))((((((...)))))).(((.((((((((.(...(((...((((.(((((.(((...((((((((.....(((((..((......))..)))))....((..((((..((((....((((((((((((((((((.((.((((((.((((............(((((.....)).)))........(((((..((((...)))).))))))))).).)))))))))))((((((.((((((.((((((.((.(((.(((((((((((...((....))....))))))))..(((((((.(...(((((((((((..(((..((((((...))))))((((((...((..((((((((((((...(((...(((((((((..(((((...(((.((((((...)))..)))))).))))).....))))))))).)))..))).)))))).)))..)))))))).........(((.((......))..)))..))).....)))))))........((((...))))((((.....))))....)))).).))))))))))))).)).)))))).(((((.(((...(((.(.(((....))).).)))..))).)))))...........((((((........))))))......))))))...)))))).)))))))..)))))))...)))))))).))((((((......))).))))))))))).)))...(((((((((..((((((((.(((..(((.((.((......)).)).)))..))))))))))))))))))))....((((.............))))((((((.((((...((.(.((((((((....))).....)))))).)).)))).))))))...........((...(((((((...(((((.......))))).)))))))....)).(((((.((....)).)))))..))))).))))....))).).))))))))..))).))))))))))).))))....))))))).))))..(((((....(((.((((((((((((((.....(((((((((((((...(((......))))))))).))))))).....)))))))))))))).)))((((((.(((((((....))))))).)))))))))))))))))))).))))))))..))))....)))))..)))))))))))))(((.(((((((((((....(((((((....((((((((((((...((.(((((((.(((((.((..(((((((.(((....))))))))))..(((((...........)))))((((((..(((((.(((((((((((((....(((((((((.(.((((...........((((((....))))))..)))).))))))))))))))))))))....)))..))))).)))))).((((((((((((((.(...(((((.(((((....))))).(((((((............(((((((((....))))))))).........))))))).....((((((((.(((.((((..(((((((....((((.......)))).))))))).)))))))....))).((((((.((((..((((......))))....)))).)))))))))))..((((((......)))))).......)))))).)))))).)))))))).)).))))).))).)))).)).(((((.....)))))..((......))........)))))))))))).....((((.(((....(((((((....))))))).))).))))((((((.(((....)))))))))...)))))))...)))))).)))))..)))....((((...))))).)))))).)))))).)))))..)))))......(((((((..(((((...((((((.((((............)))))))))).........)))).)..)))))))....(((........))).)))).)))))))))))))))))))))).....)))))))..))))))))))))))...))))...))))))))))))))))))))).))))...)))))....).)).)))).)))))...)))))).)).))))).))))....((((((((((((((((((..(((.....((((((((.((((.(((((((.((((((.(((((..(((((((((...((((((((((((((((((.......).))....)))))))).....(((((((.(....(((((..(..(((((.....))..........(((((((((......)))))))))((((........)))).....((((((.(.((((((((..((((((..((((((((((((....)))))).((((.((.((((.......)))).))))))(((((.(.....).))))).((((((((((..(.(((((((((((.(((......)))..))))).........((....))...((((((........)))))))))))).)..))))))))))...)))))).))))))..)))))))).).)))))))))..)..)))))))))))))(((((.(((..(((..(((((((((..((...((((...((.........))...))))))..))).))))))..)))..))).)))))...(..(((.(((((.....)))))..)))..))))))))...)))))...(((((.((((((((((((...((.(.((((((.(((((((((..(((..(((((..((((.(((...((((..((((....))))..(((((((.((..(((.((((((...(((.((....)).))).)))))).)))..(((((((..(((.((((..(((...(((((.(..(((((((((.(((.((((....))))((....))....(((.((((((.((..(((((......))))))).)))))))))))))).))))))).).)))))((((.(((.((.((((((((.((.((((((((((.((((..(((.(((((((.((.((.((.((.(..((.((((..((.((.(((.((((.(((((((((((.(((.((((.(.(((((((((((.......((((((((((.....(((.(((((((.....)))).)))))).((((((......))))))))))))))))..(((((((((((((...(((((((.(((((((((((..((((....((((.(..((((((((.(.((((...)))).).))))))))..).))))..))))..(((((((.(......).)).)))))..(((((((((...)))))..(((....))).(((((((((((.(((...........((((.((((.......))).).)))).......((.......))))).)))))))).)))..(((.(((.((((((........))))))))))))..))))...)))))).)))))...)))....))))...))))))).))))))))))))))).)))))))..))).))).))))))))))))..))))).)).........))))))...).)))).)).))(.((.(((((....))))))).)............(((((((.((..(((......)))..))))))))).((((((((.((((....)))))))))..)))))))))).)))..))))))..((.(((.....))))).)))))))))).)))))))))).))))))).))).))))..)))...))))))).)).))))).)).......(((.((......)).))).))))...))).))))..))))))))..)))..)))...)))...)))))).).)))))))).......)).))))))))).))))..)))))(((((.......)))))...)))))))))))))))).).))))))))))).)))))....)))))))((((...((((((....)))))).)))).............((((.....))))............................)))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((((((...(((((.((((((.((.,.(((((((((((.(.(((((..((((({{.(((({(((((,{{,...,.(((((((((((((...(((.........,))).,))})))))))))).|{{((.({((((({(((({{....))).,))))))}))}})))|.|..,((((((((..,(((((((((..(((((.........))))).)))))))))}.............(((((((((.((({......((((((,(({.,.||}|....,.........(((((((..........)))}}))..))))}}(((((((((...(((.....)))...)))))))))....,,{({.({(((((...(((((.((((((.((((((.(...((((....)))).....(((((((((((((..((.(((...((((..((((((((((((.(((.((,{((.....{.(,.{..(((.(((((((.((.((((((((((....))))))....)))).)).))))))).)))..})).,..))))).))).))))(((((((((((((.(((((((..,((((..,.,{((,,,||}}{{{{,,...,({....}}|(((((..(((((((...{((((((.((.(((((.((.((....)))).))))).)).))))))}.(((..((((....{.(((((,...,))))).}...)))))))))))))).))))))||,||{((({{{||,,||||||||||.{{,((({,{{{,,..||},.}}|,}|..((((((((((((.((((...(((.........))).)))).))))...)).)))))){{(((((((....)))))))))||,{..,}}}},,}},)),.(((((((((((,.,(({{,...,{,{,({,,,{,(({{{..,,,))|}}.{{{...,|{|,......)))).),.,,||||}}})),},|{((..((((((((.(...(((.{.((((.(((((.(((,..,(((((((.....(((((..((......))..)))))....((..((({..((((....((((((((((((((((((.((.((((((.((((............,(({(,....}}.}}}|....}..(((((..((((...)))).))))))))).).)))))))))))((((((.((((((.((((((.((.(((.(({((((((((...((....))....)))))))).,(((((((.,.,.(((((((((((,{(((..((((((...)))))),,{{{,...{,,{(((((((({(({.,.|{{...(((((((((.,(((((...((,,((((((...)))..)))))).))))).,...))))))))).})}..|}}.,}}})).}}),,||||||||....}}}},,})}|,...,,,|,..)))).}}},},..)))))))........((((...))))((((.....)))).}}}).}..}.))))))))))))).)).)))))).(((((.(((...(((.,.{((....})).).)))..))).)))))...........((((((........))))))......))))))...)))))).)))))))..)))))))...)))))))).))((((((......))).))))))))))}.}||...(((((((((..((((((((.(((..(((.((.((......)).)).)))..))))))))))))))))))))....|{{{.............))))((((((.((((...{(,{,(({(((((....))).},..))))),,)).)))).)))))).,.........||,|,(((((((...(((((.......))))).)))))))...,},.(((((.((....)).)))))..))))).)))),.,.))).}.))))))))}})),.))))))))))).)))),...))))))).)))).,(((({..,{(((.((((((((((((((.....(((((((((((((,..(((......})))))))).))))))).....)))))))))))))).)))}|((((.(((((((....))))))).))))},)))))))))))))).))))))))..))))....))}))..))))))))))))){((.(((((((((({....(({((((,{,.{(((((((((((...((.(((((((,,,,,.,}|}}{{(((((,{((....)),}))))}}..(((((((,,,,,....((.||((((((,.((((,{(({(({((({{{{.,,,{||||||{.||,|{{|||,|.......((((((....))))))..)}))))))))))))))))))))))}..,,,||,.,,|||{||,,((.((((((((((((((.{...(((((.(((((,,..|||||.(((((((............(((|((((({........)))))},,,,...))))))).....((((((((.(((.((((..(((((((....((((.......)))).))))))).)))))))....)))}((((((.((((.,((((......)))).,..)))).)))))),))))..{{{{{,...,,,)))))).}.....)))))}.)))))).)))))))).))..)))),)}|,,))),}}||{{||,,,,,)}}))...|,.,.,})),)}}}...))))))))))))....{((((.(((....(((((((....))))))).))).))))|(((({,(((....)))))))),...))))))).,,)))))).)))))..)))....((({...))))).)))))).)))))).)))))..)))})..,))}.)})))).)))))))))(((((((((({.{.........})))))))))).....)))))))).,.,{{{(({,,..}|||,.....{{||{..}|||{.,,,,}})}}.)...)))),))))).}),)))}}..)))))...))))).,...))))..))))))).,)))).))))..)))))..))))))|{(,(({((({{{....((((((((({{,({,{((((.{......}))))}.((((((((((((..((({..,,((((((((.((((.(((((((.((((((.(((((..(((((((((...((((((((((((((({((.......,.))....)))))))).....(((((((.,....(((((..(..(((((.....,}.||.......(((((((((......))))))))){(((.,....,.)))|.....((((((.(.((((((((..((((((..((((((((((((....)))))).{{({,((.((((.......)))).))))))(((((,,.....},))))).((((((((((..(.(((((((((((.(((......)))..)))))...{{....,{....))...((((((........)))))))))))).)..))))))))))...)))))).))))))..)))))))).).)))))))))..)..)))))})))))))(((((.(((..(((..(((((((((..((...((((...((.........),...))))))..))),})))))..)))..))).)))))...{..(((.(((((.....)))))..)))..})))))))...)))))...(((((.((((((((((((...((((,((((((.(((((((((..(((,.(((({..((((.(((...((((..((((....))))..(((((((.((..(((.((((((...(((.((....)).))).)))))).)))..{((((((..(((,((({..{{{...((({({{..,||{|||||,|||,|{{{..,,||||((,,..||,{.{(((.(((((({(({{(,(((...,,}))))))}.,))))))))),))).))})))),)})})))((((.(((.((.((((((((.((.((((((((((.((((..(((.(((((((.({.((.((.((.(..((.((((..((.((.(((.((((.(((((((((((.(((.(((({(.(((((((((((.,.....((((((((((.,,..{{(.(({((((.,,.,|||||,}}))).|||{||.,,,,,)))))}))))))))))..(((((((((((((,,.(((((((.(((((((((((.,((((.({(({,(.{..((((((((,{,{({{...}))).}.)))))))).,}}))))..}}))|.{{{(({{.{......}.)}.)))))}.{{{(((((,...))))).,,{|..,.))).,,{((((((((.(((...,.....,,({{{,,(({.......})).).})))...,...({.......)}))).)))))))).}}}..(((.(((.((((((........))))))))))))..)))).,.)))))).)))))...))),...))))..,))))))).))))))))))))))).))}))))..))).))).))))))))))))..))))).)).........))))))...}.)))).)),|}({,{.(((((....))))))).}.}...||..,},(((((((.((..(((,....,)))..))))))))).((((((((.((((...,)))})))))..)))))))))).)))..))))))..((.{((.....))))).)))))))))).)))))))))).))))))).}}}.)))),.)))...))))))}.,),))))).)).....,.(((.((......)).))).))))...))).)))).,))))))))..)))..)))...)))...))))))}).)))))))).......)).))))))))).))))..)))))(((((.......)))))...)))))))))))))))).).)))))))))))})))))....)))))))((((...((((((....)))))).)))).......,)))...,))))))))).,.....,,.....,,..........}))))))).)),.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GUCUGCGUAACCGCACGGGAAACCCGCCACCACCUCCACCUCCCUGCCA… 4945 nt 0.7039
ACCCCAGCAACCCCGGCUCCCCAGCAUCUCUCCUCUGUCCGCCUCUCCA… 5144 nt 0.7049
Summary

Predicted to enable protein kinase activity. Predicted to be involved in chromatin remodeling. Predicted to be located in Golgi membrane; axon; and dendrite. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that cocaine self-administration and re-exposure after withdrawal reprogram transcriptome-wide responses in six brain reward regions [Walker et al. DOI:10.1016/J.Biopsych.2018.04.009].