Basic Information

Symbol
LNPEP
RNA class
mRNA
Alias
Leucyl And Cystinyl Aminopeptidase P-LAP IRAP Placental Leucine Aminopeptidase Cystinyl Aminopeptidase PLAP CAP Insulin-Regulated Membrane Aminopeptidase Insulin-Responsive Aminopeptidase Leucyl-Cystinyl Aminopeptidase Oxytocinase EC 3.4.11.3 Insulin-Regulated Aminopeptidase Leucyl/Cystinyl Aminopeptidase Angiotensin IV Receptor AT (4) Receptor Vasopressinase EC 3.4.11 Otase OTASE OTase
Location (GRCh38)
5:96935394-97037513
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005575.3
Sequence length
12134.0 nt
GC content
0.3754

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3248.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3495.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3485.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005575.3 NCBI
AGUCAGCUGGGCCGCCUCAGCUCUCGGAGUAGGAAGCUCGGGCGCUCCG… 12134 nt 0.3754
NM_175920.4 NCBI
ACAGCUGAACUUGGGCAAGCUCCUAACUCCACUAAGUACAGAAGUGGAG… 12383 nt 0.3754
Summary

This gene encodes a zinc-dependent aminopeptidase that cleaves vasopressin, oxytocin, lys-bradykinin, met-enkephalin, dynorphin A and other peptide hormones. The protein can be secreted in maternal serum, reside in intracellular vesicles with the insulin-responsive glucose transporter GLUT4, or form a type II integral membrane glycoprotein. The protein catalyzes the final step in the conversion of angiotensinogen to angiotensin IV (AT4) and is also a receptor for AT4. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the LNPEP (Lnpep) was downregulated in ileum tissue from methamphetamine-treated animals compared to saline-treated controls, identifying it as one of 206 downregulated genes among 326 total differentially expressed genes in a model of methamphetamine-induced inflammatory bowel disease [Sun et al. DOI:10.21037/atm-20-7741]. A study in mice demonstrated that the LNPEP gene (Lnpep) was significantly downregulated in the ileum of methamphetamine-treated animals compared to saline-treated controls, as identified through RNA sequencing and validated by qPCR, and its genomic location is near SNPs associated with inflammatory bowel disease [Sun et al. DOI:10.21037/Atm-20-7741].