Basic Information

Symbol
LOC107987423
RNA class
mRNA
Alias
Liver Carboxylesterase 1-Like NCBI Gene: 107987423 GC16U902349
Location (GRCh38)
16:369-18055
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
NCBI

MANE select

Transcript ID
XM_017030236.3
Sequence length
1265.0 nt
GC content
0.5115

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-430.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -453.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 434.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((((...(((((((((..((((..((((((((.((((((((((((...(((((((((..(((......((((((((.(((.(((((((....))))))).)))...((((((.(.(((....))).).))))))(((..((((...))))..)))....((.......))..((((......))))...(((.(((((..(((.....)))...))))).))).)))))))).)))..)))))))))..))))..........(((.(((((((.(((.....)))...))))))))))......((((((.((((..(.(.(((.(((((.((((((.((.......(((....((((((.........((((((((..(((((((.......((((((((((((((.(((.........))).)))))))))....((((((..(((.......))).((....)))))))))))))...((((....))))..((((((((...(((((((.((((((.......)).))))..(((((...((((((..(((((.....))))).((((((((........(((.........)))))))))))((((......(((((((.(((.......))).)))))))...(((((.......)))))..(.(((((((((.(..((......))..).))))))))).)))))..)))))).))))).......(((......))))))))))..)))))))).((((((..(((((.(((((((((((((.(((....))).))).))))))).))))))))..)).))))....)))))))..))))))))((((.......))))..........((((...))))..((((((((((.((((...........))))..))..((((....(((......)))....)))).)))))))).))))))..)))....)).)))))).)))))...))).).)..)))).))))))))))))))...((((((((((((...((((......))))........(((..((((((.(((((((((....((((.....(((.((((((((....)))))))).)))))))...)))).))...))).)))))))))..))))))).)))))..)).)))))).))))..))))..(..((((((.....))))))..))))))...))))......((.((((...))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
........((((...(((((((((..((((..(((((({({((((((((((((((((((((((((..{({...,..((((((((.{((.(((((((....})))))).)))|||((((({.{.{((.|||}}}.,.,||||,,{{..((((,..|||},{{||...||||,,|,.,||||((({......}}}).,,(((.(((((..(((.....)))...))))).})}.)))))))).}))..)))))))}},{{{....,,}...,,|...(((((((.{{{...{{}},..,))})})}|||||,...{((({{{((((.{(({(,,((,(((((((({,,{{{.......,,{....|||,.,.})),...|{{,,{{(({{{,{(({{,.,....,||{{||{{{{{{{.{((,{,,,..,,|||,||||}|||}....((((((..{{{....,..}}}.{{...}}}))))))})}}}},,}|))),,|,}}}||,|||||}}}}}|||}|}}}|,|||.}}}}}.}))}}}}}..,|||}}},,|.,,,,.(((((.....))))).((((((((......,,,{{....,,...},,))))))))|)})))}}}}))))}.))}|{{{.,{{||||{||||{||,||{{(({,,||,,.}}}}}}},|||,{||,{|.,,.,,...,,,,,..|,||||||,|{{{{||,..||||||{{{|,....})}..{{|..}.,|||},,,,,}.})),,}))}.,|{{{(,,(((((.({(((((((((((.(((....})),))).)))))))}})))))))..}).))))}},.})))))}.}}},,}))}}}}))}.,,||}|||,,,.|||...{{||,.,)))),}}}}|||||||.||{|,}}|},.....}))),,)}..|||{,{{,{{{,,..||||||...,,},.)))((.((((((((({.............))))}}))))).)).,,|{{|||||{..,..))))),))))...((((((((((((,..((((......))))........{(((((((((({(,,(((((({.{{,,(({{{{{(,,.,|||||||}}..,,,,,,)).)))))))..})))).,,......)))))))}...,))))))).)))))}})).)))))).))))..))))..(..((((((.....))))))..))))))...))))......((.((({...})))))...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
XM_017030236.3 NCBI
UCACUGACCCCACUCCUGAGCAUGAACUCUCCUCCCCUCCACUCUGCUG… 1265 nt 0.5115
Summary

No relevant information is available at the moment.

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.