Basic Information

Symbol
LPGAT1
RNA class
mRNA
Alias
Lysophosphatidylglycerol Acyltransferase 1 LPLAT7 Lysophospholipid Acyltransferase 7 KIAA0205 FAM34A1 FAM34A NET8 Acyl-CoA:Lysophosphatidylglycerol Acyltransferase 1 Acyl-CoA:Monoacylglycerol Acyltransferase LPGAT1 2-Acylglycerophosphocholine O-Acyltransferase Stearoyl-CoA:1-Lyso-2-Acyl-PE Acyltransferase Family With Sequence Similarity 34, Member A EC 2.3.1.62 EC 2.3.1.22 EC 2.3.1.-
Location (GRCh38)
1:211743457-211833674
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014873.3
Sequence length
7773.0 nt
GC content
0.3866

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2112.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2263.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2394.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001320808.2 NCBI
GUCCGCAGGCAGCCGCGAGGGGAGUAGGGCGCCAGCGCGCCCGCUCGCG… 8471 nt 0.3969
NM_001375841.1 NCBI
AGUCCGGGCGAACGCGGCCGGGCCCUUGGGGACCGAGUCUCGGCGCCGC… 7917 nt 0.3950
NM_001375842.1 NCBI
GCCACGACCCUUCCACAUCCGCGGAAACCGCUGCAGGCUCCACCGGCUC… 7691 nt 0.3804
NM_001375844.1 NCBI
AGUCCGGGCGAACGCGGCCGGGCCCUUGGGGACCGAGUCUCGGCGCCGC… 7921 nt 0.3949
NM_001375845.1 NCBI
GUCCGCAGGCAGCCGCGAGGGGAGUAGGGCGCCAGCGCGCCCGCUCGCG… 7738 nt 0.3854
NM_014873.3 NCBI
AGUCCGGGCGAACGCGGCCGGGCCCUUGGGGACCGAGUCUCGGCGCCGC… 7773 nt 0.3866
Summary

This gene encodes a member of the lysophospholipid acyltransferase family. The encoded protein catalyzes the reacylation of lysophosphatidylglycerol to phosphatidylglycerol, a membrane phospholipid that is an important precursor for the synthesis of cardiolipin. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2016]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the LPGAT1 was downregulated during long-term weight loss (0 to 12 months) in weight losers within subcutaneous adipose tissue [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].