Basic Information

Symbol
LPHN3
RNA class
mRNA
Alias
Adhesion G Protein-Coupled Receptor L3 LEC3 KIAA0768 LPHN3 Calcium-Independent Alpha-Latrotoxin Receptor 3 Latrophilin-3 Latrophilin Homolog 3 (Cow) Latrophilin 3 Lectomedin 3 Lectomedin-3 CIRL-3 CIRL3 CL3
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_001387552.1
Sequence length
13738.0 nt
GC content
0.4022

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3721.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Summary

This gene encodes a member of the latrophilin subfamily of G-protein coupled receptors (GPCR). Latrophilins may function in both cell adhesion and signal transduction. In experiments with non-human species, endogenous proteolytic cleavage within a cysteine-rich GPS (G-protein-coupled-receptor proteolysis site) domain resulted in two subunits (a large extracellular N-terminal cell adhesion subunit and a subunit with substantial similarity to the secretin/calcitonin family of GPCRs) being non-covalently bound at the cell membrane. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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