Basic Information

Symbol
LPIN1
RNA class
mRNA
Alias
Lipin 1 Phosphatidate Phosphatase LPIN1 KIAA0188 EC 3.1.3.18 EC 3.1.3.4 EC 5.4.2.7 Lipin-1 PAP1
Location (GRCh38)
2:11677544-11827409
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001349206.2
Sequence length
5448.0 nt
GC content
0.4714

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1712.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1811.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1435.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001261427.3 NCBI
CUUUCCCAGGAGAGCCCAUGCGCAGGGCAUGGAUGAAAGCAAGCUGGAG… 5605 nt 0.4731
NM_001261428.3 NCBI
AGUGUCACCCAGCCCAGCCUCCCAGCUUCUGAGCCGGUGUUGCCGGGGG… 5650 nt 0.4747
NM_001349199.2 NCBI
GUGUUUGCAAUACAAAGGCGGCCACGCGCGGCGCCGCUCGAGUCUCGCU… 5458 nt 0.4733
NM_001349200.2 NCBI
GUGUUUGCAAUACAAAGGCGGCCACGCGCGGCGCCGCUCGAGUCUCGCU… 5536 nt 0.4711
NM_001349201.2 NCBI
GUGUUUGCAAUACAAAGGCGGCCACGCGCGGCGCCGCUCGGUGCAGACC… 5418 nt 0.4677
NM_001349202.2 NCBI
GUGUUUGCAAUACAAAGGCGGCCACGCGCGGCGCCGCUCGAGUCUCGCU… 5563 nt 0.4747
NM_001349203.2 NCBI
GUGUUUGCAAUACAAAGGCGGCCACGCGCGGCGCCGCUCGGUGCAGACC… 5445 nt 0.4714
NM_001349204.2 NCBI
GUGUUUGCAAUACAAAGGCGGCCACGCGCGGCGCCGCUCGAGUCUCGCU… 5566 nt 0.4747
NM_001349205.2 NCBI
GGGUCCACGAAUCAUUGUGGUUGUUAUGAUUUUAAAGUGCCACAGGGUG… 5880 nt 0.4779
NM_001349206.2 NCBI
GUGUUUGCAAUACAAAGGCGGCCACGCGCGGCGCCGCUCGGUGCAGACC… 5448 nt 0.4714
Showing 1 to 10 of 13 entries
Summary

This gene encodes a magnesium-ion-dependent phosphatidic acid phosphohydrolase enzyme that catalyzes the penultimate step in triglyceride synthesis including the dephosphorylation of phosphatidic acid to yield diacylglycerol. Expression of this gene is required for adipocyte differentiation and it also functions as a nuclear transcriptional coactivator with some peroxisome proliferator-activated receptors to modulate expression of other genes involved in lipid metabolism. Mutations in this gene are associated with metabolic syndrome, type 2 diabetes, acute recurrent rhabdomyolysis, and autosomal recessive acute recurrent myoglobinuria (ARARM). This gene is also a candidate for several human lipodystrophy syndromes. [provided by RefSeq, Mar 2017]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the LPIN1 gene, involved in lipid metabolism, was downregulated in the adipose tissue of heavier co-twins within BMI-discordant monozygotic twin pairs, indicating its association with acquired obesity [van der Kolk et al. DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100226]. Another human study investigating adipose tissue transcriptome changes in response to short-term overfeeding reported that the LPIN1 gene was upregulated in response to the energy surplus [Shea et al. DOI:10.3945/ajcn.2008.25970].