Basic Information

Symbol
LPIN2
RNA class
mRNA
Alias
Lipin 2 Phosphatidate Phosphatase LPIN2 KIAA0249 EC 3.1.3.4 Lipin-2 CRMO1 MJDS
Location (GRCh38)
18:2885296-3013345
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001375808.2
Sequence length
6052.0 nt
GC content
0.4888

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2057.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2166.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1278.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001375808.2 NCBI
GCAGUCCAGCCGCCGCCUGCCCUCAGCCGCCCGCUGGCCGGGAGCGGAG… 6052 nt 0.4888
NM_001375809.1 NCBI
GCAGUCCAGCCGCCGCCUGCCCUCAGCCGCCCGCUGGCCGGGAGCGGAG… 6102 nt 0.4913
NM_014646.2 NCBI
GAGAAGAAGUGGCAGGUGAUGCUGAAGCGGGGGAGAAGCGGCAGAGCCG… 6245 nt 0.4873
Summary

Mouse studies suggest that this gene functions during normal adipose tissue development and may play a role in human triglyceride metabolism. This gene represents a candidate gene for human lipodystrophy, characterized by loss of body fat, fatty liver, hypertriglyceridemia, and insulin resistance. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the LPIN2 gene, identified as an early marker of paraquat-induced lung injury, showed a significant increase (>2-fold) at 6 hours post-exposure, with its expression pattern being adverse between the 6/24-hour and 5-day time points [Tomita et al. DOI:10.1016/J.Tox.2006.12.005].