Basic Information

Symbol
LPO
RNA class
mRNA
Alias
Lactoperoxidase SPO Salivary Peroxidase EC 1.11.1.7 EC 1.11.1 SAPX
Location (GRCh38)
17:58218548-58268518
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006151.3
Sequence length
2821.0 nt
GC content
0.5626

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1038.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1088.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 630.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001160102.2 NCBI
CUUUCCUGCUAAGCCUCAGCGUCUCCUCCAAGCCACAUCAAAAUCUUUC… 2572 nt 0.5622
NM_006151.3 NCBI
CUUUCCUGCUAAGCCUCAGCGUCUCCUCCAAGCCACAUCAAAAUCUUUC… 2821 nt 0.5626
Summary

This gene encodes a member of the peroxidase family of proteins. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate the mature enzyme. Following its secretion from salivary, mammary, and other mucosal glands, this enzyme catalyzes the generation of the antimicrobial substance hypothiocyanous acid. This gene is present in a gene cluster on chromosome 17. Alternative splicing results in multiple transcript variants, at least one of which encodes a preproprotein that is proteolytically processed. [provided by RefSeq, Jan 2016]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.