Basic Information

Symbol
LRCH3
RNA class
mRNA
Alias
Leucine Rich Repeats And Calponin Homology Domain Containing 3 Leucine-Rich Repeat And Calponin Homology Domain-Containing Protein 3 Leucine-Rich Repeats And Calponin Homology (CH) Domain Containing 3 DISP Complex Protein LRCH3 MGC4126
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_001365715.1
Sequence length
7129.0 nt
GC content
0.4664

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2520.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2645.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1325.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((.(((.((((((((((((...(((.(((.(((((((((((((.((((((.(((((((((.((......)).)))))))...((((((...)))))))).)).)))).)))).)))))).))).)))..)))....))))))))((((.((((((.(((((((((.((.....(((((......)).)))((((.((.((((.....)))).)).))))(((((((.....))))))).)))))))))))...))))))))))...)))).))).)))))(((.(((..(((....)))....)))....)))...(((((((........)))))))((((((.((...(((..((((.......))))..))))).))))))(((((((((..(((.((((....((.((((..(((......((((..((((...((((((((((((.(((.(((.....(((.((.((((((((.((((......................((((((..(((.....)))....))))))..)))).)))))))))).)))..))).)))))))))..........................(((((((((..((((((.((.(.....((((((...((.......))..))))))..))).))).)))..))).)))))).)))))).)))).)))).((.((((((((..............((((...(((.....)))..))))....(((((((((......(((...(((((....((((((((((((((((((.....((((((((((((((((((((...............(((((((((((...((.(((((((((((((((..((...........))(((((....)))))((((....))))(((((..(((...(((((..((((....)).)).)))))..))).)))))....((((((((((((((...((((((((..((((..((((....(((((..........))))).((((((((((........((....))........))).)))))))..(((.((((..(((((((.....((((((((.......)))))((.((((((((((.((.((((...(((...((((..(((((..((......(((((((((...(((((.(.((((((((((((((...((...(((((.((((((....((.(((((.....((((..(((((..(((.((.(((((((....)).))))).))......((((...((((((.((((((.............((((((......))))))...........((((....((((.......(((((((((...(((....(((.........(((((((.....))))..)))...((((......))))((.(((((.(((.((((...(((.....))))))).))).)))))))))))))...)))))).)))....(((((..((((..((....))..)))))))))(((((((((...............))))))))).......)))))))))))))).)))))).....))))..((((.(((((.......))))).....)))).))).))))).))))))))).))...)))))).)))))...))...)))))))).))..))))).))))).)))))))))((((((((((....)).))).))).)).......)))))))..))))...)))...))))..))))))..)))))))))))...)))))))..))))))).....(((........)))...(((((((..((((.(((....))).)))).)))))))....(((......))).....)))).))))....)))))).)).....))))))))..))))))...(((......))).......((((..(((((.(.....((((((..((((((.................))))))...)))))).....).)))))..)))).))))).))))))).))).))..((((((((((((((((...((((((((.((((.((((((((.(.((...(((((((((...((((((..((((((((((.............)))))....(((((((....((.((((...))))))...))))))).......))))).......))))))...))))))).((((.(........).))))...))...)).).)))))))))))).((.((((((((((((((......((.((.......((((((((..........)))))))))).))....))))))....)))).)))))))))))))).)))))))))..)))))))(((.((((....)))).))).((((.....)))).)))))))))))......((((....))))...((((((...)))))).......((((((((((((((((((((((((((((((......(((.((...(((((...)))))...)).))).......)))))..))))))))))(((......)))..(((...((((((((((((...((((((((.(((((((((...(((((....((((((.....)))))).))))))))))))))..((((..((....)).))))((..(((.((.(((((((((((((((((.(((((((((((((..(((..(..(((((((....((((((.((((((((.....((.(....(((((((...(((..(((..(((((...........((.(((((.(((((((((..((((.((((((.((((((.(((((.((.(((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((.((.((.(((((...((((((((((..((((((((((.(((((((((((((((..((((((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((((.(.(((((((((((((((((.(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((....)))))......((.((((((((....(((((((((((..((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((......((((((((((......(((....)))......))))))))))...((((((((.(.......).))))))))..(((((.((((.((((.(((.((((.((((.((((((((.(........)))))))))..........)))).)))))))...))))......)))).)).)))..((((.((((...)))).))))..........(((((((.((.((...)).)))))))))..((((((((((.((((((.((.((((.(((..(((((((((((.((((((((((..(((..(((((..((((((((((((((((((((((((((((((((.((.(((((((((((.(((.(((((((((((((...((((...((((((....(((..(((((......(((((((....)).))))).....)))))...))).......(((((((.....)))))))....(((((....((((......................))))...)))))..((((....(((((((((((.......................))))..(((((((....))))))).....)))))))...))))..)))))).............((......))))))...)))).))))))))).(((((.((...((((((((.....(((((.....((((.((.....)).))))...))))).........))))))))..)).))))).(((.......))).....((((.........))))))).))))))))))).)).))))))))))))))))))))))))))))))))..)))))..)))..)))))))))).)))))))))))..))).)))).)).)))))).))))..))))))..........))))))))))))))).)))))))))))))))))).)))).)))))))).))).((((..((((((...((((((....((.(((.((((((.(((......).)))))))))))))..))))))......))))))..))))....................((((....((.(((((((.((......................)))))))))))...))))....)))))))).))(((..((((.....(((..(((....)))))).....))))..)))..((((((((.(((((((.(((((((((((((....)))).))))(((((..((((((..(((.(((((((.((((((((((....))))))))))))....))))).)))....(((((...(........).)))))...(((.(((....))))))...)))))).)))))....))))).))))))).)).))))))((((......))))..((((((((((.((((((((((.....((((((((...))).))))).......))))))))))...))))))))))...............))))))))))))))))))))))))).))))))))))).))))))))))))))))).).))))))))))))..))))))))))))....((((((((......)).((((...))))............................)))))).((((((((...((.((......))))......(((((((((((((((.(..((((((..(((((((..(..(((((....((((((....))).)))....)).))))..)))))))....))))))..))))))))........(((.((((((....((((.(((................((((..(((((.((((((((.....)))))...))).)))))...)))).............(((...(((((((....))))))).)))....))).))))...)))))).)))...((((.(((((.......)))))..)))).))))))))........))))))))(((......)))....(((((((....)))))))...........)))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))))))).))))))))))..))))))))))...))))).)).)).))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))).)).))))).)))))).))).......................))).)))).)))))))))....)))))))........((((((((((((((((((((((...((((((...))))))...((((((((...)))).)))).(((((........))))).....)))))....))))).........)))))).))))))..........((((((....))))))..(((((((....(((.(.(((((....(..(((.((..(((((((((((.(((((...)))))))))))))).))..)).)))..)...))))).)))).((((((.(((((.......)))))((((.(((..........))).))))(((((.((((((.((((......)))).((((.......))))..........((((((((((........))))))))))......((((((((.(....(((((......((((.((((...))))..((((..((.......))..)))).))))....))))).(..(((((((((........)))))))))..)..........(((((.(((((((..(((.((((((.((((........)))).))......(((((..(((((.(((.((((....((......))..))))....))).))))).)))))..(((((((...((((..((((((..(...(((........))))..)))))).))))...)))))))))))...))).....)).))))).)))))..(((((((...)))))))).))))))))....((((.(((((.(((((...((((((....((........))..))))))......))))).))))).))))((((...)))).)))))))))))))))))...(((((.(((((...((((((....((......))..))))))......))))).)))))...((((((...)))))).)))))))..((.((((((..((((...))))..)))..))).))........)))))..))).)))..(((((((.....)))))..))....)))))))....).)).....))))))))))))))))))))).).)))..)).))))))))))).)))))))..(((.........)))((.(((((.((((...)))).)))))))....)))))))))).)).)))..)).))))))))))))))))))))...)))..(((((((.(((((..((((......((.....(((.((.........)).)))..))....))))..)).))).)))))))............))))))....)))))))))....))))).)))....)))))).))))))....))))))..)))...((((((((((..(((((.........))))).)))))))))).........))))......)))))....))))).))).....)))))))))....)))))))).)).........)))..)))).)).....)))).))).....))))))))).(((((((((.......(((................)))......)))))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((.(((.((((((((((((...(((.(((.(((((((((((((.((((((.({(((((((.((......)).)))))))...((((((...))))))}).)),}))).))))})})))).))).)))..)))....))))))))((((.((((((.((((((({({((.....(((((......)).)))((((.((.((((.....)))).)).))))(((((((.....))))))).)))))))))))...))))))))))...)))).))).)))))(((.(((..(((....)))....)))....}))...(((((((........)))))))((((((.{{...(((..((((.......))))..)))}}.))))))(((((((((.,(((.((((.,..((.((((..{{,..,.,,{(,{{{,,,,..}||,|,.((((({,(((.(((.....({{.,,.((((((((.((((...,,,.,,....,,.},,...((((((..{((.....)}}...,))))))..)))).)))))))),,.}}},.))).)))))))))..............,,....{{{,..(((((((((..((((((.((.(.,...((((((....(.......}}..)))))).,))).))).)))..))).)))))),)))||}.))}|{|{||,,,.((((((((..............((((.,,{{,...,,},,..))))....(((((((((......,,({,,({(((,,{{(({{,,((,(((((((((.,.,.(((((((((((({(,(((({.............{,(((((((((((...((.(((((((((((((((,,{{...,,{{{.,,{{(({((,...}}}},}|||,,,,)})}{((((..(((.,.(((((..((((....)).)).)))))..))).))))}....((((((((((((((...((((((((..((((..((({.,..(((((,,....,,..})))).((((((((((........,,.....,........))).)))))))..(({{((((..(((((((..{{,({,(((((.......)))))((.((((((((((.{{.((((...(((...((((..(((((,,{{.{,...(((((((((...(((((.(.((((((((((((((...((...(((((.((((((....((.(({{(.....{{{,..{{{||,,|.,.((.(((((((....)))))))).)).||,..{{{{...((((((.((((((,{{........}}|(((((......)))))}...,,....{{((((...(((((((((.(((({((,,((((..,,..{{((..,.........}|||,.....))))..|||...((((......)))),,.{|||,..,,.(((,...}}|)).))))))))))))).),,)))))),.,,.,,,}|,}|.,......(((((..((((..((....))..)))))))))(((((((((....,.....,....))))))))).........,,,,}})))))).)))))).....)))),,{|||.(((((.......))))).,{{{|,,,.))),.||||,|||,}}))),)),,,)))))).)))))...))...)))))))).)).,})))).))))).))))))))){,(((({,{(,....),))).})}.}}......}),)))))..)))).,.)))...))))..}}))))..)))))))))))...)))))))..))))))).....(((........)))...(((((((..((((.(((....))).)))).)))))))....(((......)))...,.)))).))))....)))))).)).....))))))))..))))))...{{|,,,...))},,.....((((..(((((.(.....((((((..((((((.....,,...,,.....))))))...)))))).....).)))))..)))).))))).))))))).))).))..((((((((((((((((...((((((((.((((.((((((((.{.((...(((((((((...((((((.,(((((({(((.............})))}....(((((((....{,.((({...}))),}...))))))).......})))).......))))))...))))))).((((,{........).})))...))...)).}.)))))))))))).((,((((({{{{|||||..|,{{{{,{{,{,,,,,((((((((..........))))))))}).||....))}))).,,,)))).}}}}}})))))))).))))))))}..)))))))(((.((((....)))).))).((((.....)))).))))))))))).,},..((((....))))...((((((...)))))).......(((((((((((((((,((((((((,...,,}}.,||||..,{,...,,{{|,.{|||,,..,...{|{{{{{..{{{.{{....}}))),.,,)}}}}}},}|,.(((...((((((((((((,..,(((((((.(((((((((...(((((....((((((.....)))))).))))))))))))))..|(((..{{....}}.)))|((..(((.((.(((((((((((((((((.(((((((((((((..(((..,..(((((({...,(((((((((((((((.....((.{.,{.(((((({...(((..(((..(((((.............(((((((((((((((.(((((..,.((((.((((((.(((((.((.(((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((.((.((.(((((.,.((((((((((..((((((((((.(((((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((((((,.,(((((((((((((((((((((.(((({(((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((((.(.(((((((((((((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((,(((({{{,||||||,,,,.((.((((((((....(((((((((((..((((((((((((((((((((((.(((((({((((((((......((((((((((......(((....)))..,,..)))))))))),,.((((((((.{{{.....)}))))))))..({(((,({((,((((,({{.((((,((({.((((((((.(........)))))))))..........}}}|.}}}}}}}...}}}}......)))).))},))..((((.((((...)))).))))..........(((((({,{{,{{...}).))))))))).,{(({{,((((.((((((.({.((((.(((..(((((((((((.((((((((((,,(((..(((((..((((((((((((((((((((((((((((((((.((.(((((((((((.(((.(((((((((((((...((((...((((((..{.(((.,(((((......(((((((....)).))))).....))))).,.|}}.......(((((((.....)))))))....{{|||,,,,,||,..................,.,,,.,,...,,}||,,,,,{..,.{((({{{.||,..............,{.....,.,,,...(((((((....})))))).,,,,))}))})...}))),.}))))),{...........{{......)}))))...)))).))))))))),(((((.((.,.((((((((,{...(((((...{{((((.,,...,}))})),,...)))))..,,.....)))))))).,)).)))))}(((.......))).....((((.........))))))).))))))))))).)).))))))))))))))))))))))))))))))))..)))))..))).,)))))))))).)))))))))))..))).)))).}).)))))).))))..,))))}..........))))))))})))))).)))))))))))))))))).)))).)))))))).))).((((..((((((,..((((((..{.((.{((.((((((.({,.....,},))))),))}})))..))))))......}))))}..}))}.,,,........}}....|.((((....((.(((((((.({...................,,.}))))))))))...))))....)))))))).)){{{..{(({,....{{{..{{|....))}})),,,,,}}))..})),,||||{{({.({{{(({.(({{((((({({(....)))),})))|{({{..{{{,{{{|{{{.{{{{{((.((((((((((....))))))))))))..,.})}}}.)))}},.{((({...,........}.))))}...|||,{{{..,,))))))....,}}},.}})}}....}))}}.}}}}})),)},)}}}),{{{,......||}}..((((((((((.((((((((((.....((((((((...)))}}}))).......))))))))))...))))))))))........,......))))))))))))))))))))))))).))))))))))).))))))))))))))))).).))))))))))))..)))))))))))),,{,{(((((((......)).((((...))))............................)))))),{(((((((..,{.(((((({,((((((.,....|.))))))|(((((.({.(((((,.(((((.(,...,}.)))))..))))},))..(({((|{....,}}....}})))((((((...(((({(({.....}}}}...........{{,.......||.}))}...)))))).,{,....((((..(((((.((((((((.....))))}..,))).)))))...)))).....,},}}}}},.....{((((((....)))))))...{{{{{(({....|{...},)},.)))))}}},(,((({{...,,,.}}}}}..,))))))).}...........)))))))}{{,......,})....(((((((....)))))))...........}))))))))))))))))))})))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))))))).))))))))))..))))))))))...))))).)).)).))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))).)).))))).)))))).))))....})))}.,,,,..................,{{{{{{{,...,,.{{({.....,||{.,,|||{{{{|{(((((((({...((((({...})))))...,{{,((((...)))).}},}.(((((........))))).....))))}...,}))))...,,}}..})}))),})))}..,.{{(.{{.((((((....)))))).}}))).}}},}}}.))))))))))..|||.(((.{{..(({(((((((..(((({...})))),,,))))))}))..),.))}....((((((,,{((..((((((,(((({.....,,|||||{{{{.{{{,.,,,,...,))),))},((((((((((((.((((......)))).((((.......))))..........{(((((((((........)))))))))}......(((((((({,....((({(..,{..({{(.((((...)))),.{||{..||,...,.,))}})))).,,}}....|}}}}.,,,(((((((((,,....,,))))))))}.||,,....{{{.(((((.((((({(..(((.((((.(.((((...||||.,,}},....{{{.((((|..|||||.|||.{|||..,,||....,}))..}))}....|}}.}}))).))))).||||((((...}||},,,}})),.,))}....,}}.}}}})..})))).))).((({...)))).)))))))))))))))))...(((((.(((((.((((((((....({.......})..)))),..,))).))))).)))))...((((((...)))))).))).)))))).....((((.(((((.(((((.((((((((....((......))..))))}..}))).))))).)))))..))))((((.{.....,.)))).,.{{,({,(((..(((((.(((((...((((((....({........})..))))))......))))).)))))..)))..),).))}.......)))))..))).)))..{,(((((,...,)))))..},....})))))).,,.}.)).....))))))))))))))))))))).).)))..)).))))))))))).)))))))..(((.,.......))){,{(((((.((((...)))).))))))}....)))))))))).)).)))..)),))))))))))))))))))))...))),|{{(((((.{(({{..{{{{.....,(({{{{{(((.((.........)).))}.,))...,))))..)).))}.))))))}}},,.....}}.))))))....)))))))))....})))).))}....)))))).)))))),,,.))))))..))).}}((((((((((..(((((.........,)))).)))))))))).......,}))),..,,,.}))},....))))),,}).....)))))))))....)))))))),)).,}}}}}},)}}..)))).))...,.)))).))}..,,.))))))))).{((((((((.......(((....,,,.......|.}},......))))))))),.......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GGUCCGGCCGCGCAUGCGCUGAGCUGGCGGGCCCGAGUGUUGUCGGCUG… 10186 nt 0.4467
GGGCCCGAGUGUUGUCGGCUGGGAAAUGGCGGCCGCGGGCUUGGUCGCU… 7129 nt 0.4664
GGGCCCGAGUGUUGUCGGCUGGGAAAUGGCGGCCGCGGGCUUGGUCGCU… 10050 nt 0.4453
GGGCCCGAGUGUUGUCGGCUGGGAAAUGGCGGCCGCGGGCUUGGUCGCU… 7057 nt 0.4656
GGGCCCGAGUGUUGUCGGCUGGGAAAUGGCGGCCGCGGGCUUGGUCGCU… 7021 nt 0.4660
GGGCCCGAGUGUUGUCGGCUGGGAAAUGGCGGCCGCGGGCUUGGUCGCU… 2149 nt 0.4649
GGGCCCGAGUGUUGUCGGCUGGGAAAUGGCGGCCGCGGGCUUGGUCGCU… 2277 nt 0.4791
Summary

Involved in septin cytoskeleton organization. Located in cytosol. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.