Basic Information

Symbol
LRCH4
RNA class
mRNA
Alias
Leucine Rich Repeats And Calponin Homology Domain Containing 4 LRRN1 LRN Leucine-Rich Repeat And Calponin Homology Domain-Containing Protein 4 Leucine-Rich Repeats And Calponin Homology (CH) Domain Containing 4 Leucine-Rich Neuronal Protein LRRN4 Leucine-Rich Repeat Neuronal Protein 4 Leucine Rich Repeat Neuronal 4 PP14183
Location (GRCh38)
7:100574011-100586161
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002319.5
Sequence length
3177.0 nt
GC content
0.6550

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1441.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1488.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1077.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001289934.2 NCBI
AGUCAGGCAGCGGGAGCCGCCGGGAGCGGAUGGCGGCGGCCGUAGCGGC… 2229 nt 0.6546
NM_002319.5 NCBI
AGUCAGGCAGCGGGAGCCGCCGGGAGCGGAUGGCGGCGGCCGUAGCGGC… 3177 nt 0.6550
Summary

This gene encodes a protein that contains leucine-rich repeats (LRR) at its amino terminus and that is known to be involved in ligand binding. The carboxyl terminus may act as a membrane anchor. Identified structural elements suggest that the encoded protein resembles a receptor. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rhesus macaques investigating radiation-induced lung injury identified the LRCH4 as a top dysregulated transcript, specifically upregulated among common differentially expressed genes in irradiated lungs, highlighting its potential role as a biomarker or therapeutic target in this pathological condition [Priyanka Thakur et al. DOI:10.1016/j.ijrobp.2021.03.058]. A study in rhesus macaques demonstrated that the LRCH4 transcript was upregulated among common differentially expressed genes in irradiated lungs, identifying it as a potential biomarker for radiation-induced lung injury [Thakur et al. DOI:10.1016/j.ijrobp.2021.03.058]. In humans, a separate investigation of subcutaneous adipose tissue during long-term weight loss found that the LRCH4 gene was upregulated in weight losers over a 12-month period [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].