Basic Information
Symbol
LRG1
RNA class
mRNA
Alias
Leucine Rich Alpha-2-Glycoprotein 1
LRG
Leucine Rich Alpha 2 Glycoprotein
Leucine-Rich Alpha-2-Glycoprotein
1300008B03Rik
2310031E04Rik
HMFT1766
Location (GRCh38)
19:4536402-4540067
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
Cause of death analysis
Sudden cardiac death diagnosis
MANE select
Transcript ID
NM_052972.3
Sequence length
2605.0 nt
GC content
0.5658
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1049.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1098.70 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
459.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGAAGCAAAAGAGCAGAGCUACCAUGUCCUCUUGGAGCAGACAGCGACC… | 2605 nt | 0.5658 |
Summary
The leucine-rich repeat (LRR) family of proteins, including LRG1, have been shown to be involved in protein-protein interaction, signal transduction, and cell adhesion and development. LRG1 is expressed during granulocyte differentiation (O'Donnell et al., 2002 [PubMed 12223515]).[supplied by OMIM, Mar 2008]
Forensic Context
A study in mice demonstrated that the LRG1 was upregulated in hearts after cecal ligation and puncture (CLP) operation, with its expression pattern noted as part of the gene expression signatures of sepsis-induced myocardial injury [Yan et al. DOI:10.3389/fphys.2022.903164]. In human patients, research identified the LRG1 as a differentially expressed mRNA with potential diagnostic value, showing it was downregulated in myocardial fibrosis versus acute myocardial infarction and upregulated in heart failure versus myocardial fibrosis, and receiver operating characteristic analysis indicated an area under the curve >0.6, supporting its diagnostic capability for both conditions [Wang et al. DOI:10.3389/fcvm.2021.664044]. A study in human blood plasma from 103 individuals demonstrated that the LRG1 (Leucine-rich alpha-2-glycoprotein) was significantly upregulated with age and was utilized as part of a 21-protein panel to build age-predictive models [Salignon et al. DOI:10.18632/aging.204787].