Basic Information

Symbol
APMAP
RNA class
mRNA
Alias
Adipocyte Plasma Membrane Associated Protein C20orf3 BSCv Adipocyte Plasma Membrane-Associated Protein Protein BSCv Chromosome 20 Open Reading Frame 3
Location (GRCh38)
20:24962925-24992782
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020531.3
Sequence length
2202.0 nt
GC content
0.5254

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-801.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -841.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 652.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_020531.3 NCBI
GGAGUCUGAGCCGGCGCCGCUCAGUGUGAGGUGGUUUCUGCGGGUGAGG… 2202 nt 0.5254
Summary

Enables arylesterase activity. Located in cell surface and membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the APMAP mRNA is a candidate for time-of-day prediction in forensic bloodstain analysis, where its expression pattern contributed to a penalized regression model achieving a root mean squared error of 3 hours and 44 minutes for estimating deposition time [Gosch et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103287]. In a separate human study, the APMAP protein was found to be overexpressed in menstrual blood-derived mesenchymal stem cells from women with endometriosis, identified through integrated proteomic analysis [Penariol et al. DOI:10.3390/ijms231911515].