Basic Information

Symbol
LRP5
RNA class
mRNA
Alias
LDL Receptor Related Protein 5 LR3 BMND1 OPTA1 VBCH2 EVR4 LRP7 HBM OPS Low Density Lipoprotein Receptor-Related Protein 5 Low-Density Lipoprotein Receptor-Related Protein 5 LRP-5 LRP-7 EVR1 OPPG Low Density Lipoprotein Receptor-Related Protein 7 Low-Density Lipoprotein Receptor-Related Protein 7 Osteoporosis Pseudoglioma Syndrome Exudative Vitreoretinopathy 1 PCLD4
Location (GRCh38)
11:68312447-68449275
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002335.4
Sequence length
5177.0 nt
GC content
0.6289

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2173.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2261.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1599.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001291902.2 NCBI
GUCGUCCUGGUCCGCGGCGCCCGAGGGGGGAGGCGGAGGCGCCGGGAGC… 5199 nt 0.6286
NM_002335.4 NCBI
GUCGUCCUGGUCCGCGGCGCCCGAGGGGGGAGGCGGAGGCGCCGGGAGC… 5177 nt 0.6289
Summary

This gene encodes a transmembrane low-density lipoprotein receptor that binds and internalizes ligands in the process of receptor-mediated endocytosis. This protein also acts as a co-receptor with Frizzled protein family members for transducing signals by Wnt proteins and was originally cloned on the basis of its association with type 1 diabetes mellitus in humans. This protein plays a key role in skeletal homeostasis and many bone density related diseases are caused by mutations in this gene. Mutations in this gene also cause familial exudative vitreoretinopathy. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2014]

Forensic Context

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