Basic Information

Symbol
LRPAP1
RNA class
mRNA
Alias
LDL Receptor Related Protein Associated Protein 1 Alpha-2-MRAP A2MRAP HBP44 RAP Low Density Lipoprotein-Related Protein-Associated Protein 1 (Alpha-2-Macroglobulin Receptor-Associated Protein 1) Low Density Lipoprotein Receptor-Related Protein Associated Protein 1 Alpha-2-Macroglobulin Receptor-Associated Protein Low Density Lipoprotein Receptor-Related Protein-Associated Protein 1 39 KDa Receptor-Associated Protein A2RAP MYP23 MRAP
Location (GRCh38)
4:3503612-3532446
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002337.4
Sequence length
10446.0 nt
GC content
0.5288

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4480.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4645.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2245.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002337.4 NCBI
GCAGAGGAAGAUGGCGCCGCGGAGGGUCAGGUCGUUUCUGCGCGGGCUC… 10446 nt 0.5288
Summary

This gene encodes a protein that interacts with the low density lipoprotein (LDL) receptor-related protein and facilitates its proper folding and localization by preventing the binding of ligands. Mutations in this gene have been identified in individuals with myopia 23. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Dec 2013]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the mRNA of the LRPAP1 was significantly upregulated in salivary extracellular vesicles from emergency department patients with acute head trauma compared to healthy controls (p=0.0102) [Cheng et al. DOI:10.1002/jcp.28139]. A study in humans demonstrated that the LRPAP1 gene was downregulated during long-term (0 to 12 months) weight loss in subcutaneous adipose tissue of weight losers [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].