Basic Information

Symbol
LRRC1
RNA class
mRNA
Alias
Leucine Rich Repeat Containing 1 LANO DJ523E19.1 Leucine-Rich Repeat-Containing Protein 1 LAP And No PDZ Protein LANO Adapter Protein FLJ10775 FLJ11834 LAP (Leucine-Rich Repeats And PDZ) And No PDZ Protein Leucine-Rich Repeat-Containing 1
Location (GRCh38)
6:53794497-53924125
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018214.5
Sequence length
3159.0 nt
GC content
0.4365

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-927.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -986.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 916.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((.((((((((.((((((...(((((((.((.(((((.((((((((...(((((((((((((((((((((((((.(((((((..........(((.((((..((((.(((((.....))).(((........)))......((((((((((((.(((.((((.((......))))))..)))....((((((...))))))..)))))).))))))...)).))))..)))))))((((((((..((((((((((...........((((((((...)))))))))))))..)))))(((.((((........)))).)))..)))))))))))).............))).)))))((((((((((((((((((((.(((...((((((...))))))...).))......))))))...(((.(((((..(((......))).)))))..))).....))))))).)))))))..((((((......((((((..(((((((((.((.(((((((.....))))...(((.(((((..((((((.((((....((((......))))(((((((....((((.((....)).))))...))))))).))))))))))..))))).))).......((((((.((((((((((....((.((((...(((((...........((((....(((((((...(((((((((.((...(((((.(((..((((((......((((((((...........)))....)))))..)))))).)))..)))))....)).))))...........)))))...(((((((((...((((........)))).)))))))))(((....))).....(((((.((.(((........))))).)))))..((((((.....((((((....))))))..))))))(((((((((((((((((...((((....))))))))).....)))...)))).))))).....((((((....((((.((.((((.(((((((....................((((((((((((.((((((..........(((....)))..((((((((((((.((((........((((((((((.(((((((((...((((.((((.((((((....(((..(((...((((.....))))...))))))....))))................((((((.....))).))).)))))).))))(((.....)))..)))))))...........))))))))))))((((((....))))))((((((....((((((((.(.((((((.(((((((((((..((((..........))))...))))))...(((((.......)))))((((((.((.((((.......((...(((....))).))....)))).)).))))))))))).).))))).))))).))))..))))))..)))))))))))))))).)))))).)).)))).)))))).....((((...((.(((....))).)).....))))........(((((.((((((.((.......)).))).))).)))))))))))).)))))).))))....))))))....)))))))...)))))))))........(((....((.....(((((.(......))))))....))....)))......))))))..)))))))))).))))))(((.((((...((((.(((((((............(((((((......)))))))))))..))).))))..)))).))).))).))..)))))))))..)))))).......))))))..((((......)))).......)))))))))...))))))..))))).....)))))))).)))))))((((.(.((((.((((.....))))...))))).))))))))))).....))))))...(((..((((((((((.....(((((((((.......................(((((.(((....(((((......)))))....))).)))))...(((((((.(.((((......))))).)))))))((((((((..............))))))))..(((((((((((((.......)))))(((((....))))).((((...((((((.....))))))...)))).......)).)))))).....((((..((((((((((((((((((...(((((...(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))))))).......(((((((((...(((((((((.((((((........)))))).))))))))))))))))))((((((((((.......(((((.((((......(((((((((.(((....)))...)).)))))))....(((.((((((........(((((((.((((((....(((((((((((..........)))))...(((..(((.(((((((((...((((((((......(((((((((.((....)).)))).))))))))))))).)))))))))))).))).....)))))))))))).))))))))))))).))).(((((((.(((.((((.......(((((((.....)))))))((.((((((((((....)))))).............)))).)).............))))..))).)))))))....)))))))))........))))..))))))....(((.......))).....((((((...(((.(((((....))))).))).....)))))).)))).))))).)).)))))).)))))..))))))))((((((((........))))))))...)))))((((....(((((......)))))..))))(((((((....))))))))))))...)))).)))))))))......)))))))))).)))((.(((((((((((((........))))))))))))).))...)))))))).))))..(((((((((((...........((((.(((((...))))).))))...))))))))))).)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((((.((((((((.(((((({,{(((((((.{{.(((((.((((((((...((((((((((((((((((((((({(,(((({||{{.|{{.{{{(((.{(((..,,,,.{||||}.},,),}.||{.......,))),.....{{{||{(({{{,{(((,((((.({,,{{{.}|||||{,|||..,,((((((...}))))|{,||}||}..}}}))}},))}}))).})))))))|(((((({,,((((({{,,,.||,||,||,.((((((((...)))))))))}))||}}}}}}|,|.,||{,,.,,}}}))}}||}},.})}))}))|||}}.||,.|||||.,||,,||||}((((((((((((((((((({.{{{...((((((...))))))...}.))......}|}}}|...{{,.{{{{{..{||,..,,.}}}.}}}}}..,},....,))))))))}}))))).....{{,...,,,,||||{,,|||||{,{({((.(((((((,...,}|||{{,(((.(((((..((((((.((((....((((......))))(((((((....((((.((....)).))))...))))))).))))))))))..))))).)))}}}},..{{{((({({{(((,,,,..{{(((,,((.{{{{(((({(,{,......{((((({..,,(({,..((((((((.((((...((((((((..{{.................)})))))))).))))....)))).)))).....,{{,.{{{||.......,.,..,,}}....)))))}}.,,(((((((((...((((........}))).))))))))){{{....}))..||.(((({.((.(((........))),).))))),,((((((...,.((((((....))))))..))))))(((((((((((((((,({{.((((....)))),))),}},..)))...)))).))))),,,..{{{,{{....,,{{.||(((((.(((((({.........,.....,|,..((((((((((((.((((({..,..,....{||,...}))..((((((((((((.((((........{((((((((({,,{(((({{...((((.{({(.((((((,...,{(,,(((,..((((.....))))...}},}))..,,))}|{{{.........,..}|||({{.....,}}.}...)))))).}}}}{{|.....)))}.})))}}}...,.....,}}))))))))))|((((((....)))))){(((((....(((,((((.(.((((({.(((((((((((..((((.,........))))...))))))...(((((.......)))))((((((.((.((((.......{{...{{{..,,)}}.......)))).)).))))))))))).}.))))).))))).))),..))))))..}))))))))))))))).)))))).}),)))).))))))...,,{{((,{{{{,{{{,.|,}}}|}},...,}}},....,.,,(((((.(({(((,{{.......}).))}.})}.)))))})))))).))))),.,}))}}}}},))))..,}}}}.|||,,}},..},,,}}}},.}}),))),.|{|..,},{||||,|.....|||||||...,||,,,.{,...,{{{{|||{||.,,,|||||||.||||||{{,.{(((...((((.(((((((........,{..(((((((......))))))),,))..}}}.}}}},,)}}),)))})},.)},.}))}}},,},,)}))))}}},}))))))))}.{{,||}}}.,))))))),}}))))))))))...))))))..))))).....)))))))).))))),}{(((.(.((((.{{((.....))))...))))).)))}))))))),},}.))))))...(((..((((((((((.,.,.((((((({({{..,,..........,,..,},(((((.(((....(((((......)))))....))).)))))...(((((((.(,((((....,,))))).)))))}}((((((((..............})))))))......,)))||||,.......,,,,|((((,.{{{|||||{{(({...(({{((,...,||||||...|||}......{((((({{{{{{{{{,((({{(((((((.{{,((((((({((((.......,{(((((((((((((...,,,,,(((({{{{{{{,..,||||}|,,,,.....,.,|||||.||}}}|||||||||}||||||}}}}|{{{||||||.|,,,,),)))))))))}}})))))))))).,{{..{{((,{((((,.,...(((((((((.((,....,))...)),})))))).,,,{{||{{(({,{,{{{...(((((((.((((((....(((((({((((..........}}}}}...{((..(((.(((((((((...((((((((..,,..(((((((((.{{....)}.)))},))))))))))))).)))))))))))).})).....)))))))))))).))))))),,,||||,{{{{{{{||,,|||.|||||,...,.(((((((.....))))))){{,({{{((((((.,..||}}||,,,........,,}}})})},...........,}}},}}))),})))))),,..)))))))))})}......})),)))),.{{{{{.,,...))))))))))))|,||||}}}||,.{,|||}},.,}}}}.,,),,..,))))))....,,,|,|,,||,,,.,})}),..,,,}}|}}}|{((((({{(........)))))))}},}}}}}|((((.,..(((((......))))),.)))}{((((((....))))))),,...,}})))))),,))))),......)))))))))).))){(.(((((((((((((........))))))))))))).)}...,))))))).)))).,(((((((((((........,.,((((,(({{,..,))))),)}))...))))))))))).)))...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_018214.5 NCBI
GGCGACGGCGACUGGCGGGUGGGAGUGGAGGCACCGGCUGGCGGGCGGG… 3159 nt 0.4365
Summary

Located in cytosol. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the LRRC1 was downregulated in the neocortex, corpus callosum-external capsule, and striatum at 7 days post-injury following systemic depletion of neutrophils and monocytes with anti-GR-1 antibody treatment [Kounelis-Wuillaume et al. DOI:10.1177/08977151251390528].