Basic Information

Symbol
LRRC10B
RNA class
mRNA
Alias
Leucine Rich Repeat Containing 10B Leucine-Rich Repeat-Containing Protein 10B LRRC10-Like Protein ENSP00000367315
Location (GRCh38)
11:61508749-61511018
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001145077.2
Sequence length
2270.0 nt
GC content
0.6771

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1155.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1193.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 572.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145077.2 NCBI
AGUCGGCCUCCGGCGGAGGCAACGGGGGAGGCCCGAGGGCGGGCGGUGG… 2270 nt 0.6771
Summary

No relevant information is available at the moment.

Forensic Context

A study in mice demonstrated that binge-like ethanol consumption via a drinking-in-the-dark paradigm significantly upregulated the LRRC10B in the prefrontal cortex, a change that was effectively reversed by pharmacological inhibition of PARP with ABT-888 [Vallerini et al. DOI:10.1016/J.Neuroscience.2020.09.010].