Basic Information

Symbol
LRRC32
RNA class
mRNA
Alias
Leucine Rich Repeat Containing 32 Glycoprotein A Repetitions Predominant D11S833E GARP Transforming Growth Factor Beta Activator LRRC32 Leucine-Rich Repeat-Containing Protein 32 Garpin CPPRDD
Location (GRCh38)
11:76657524-76670868
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001128922.2
Sequence length
4207.0 nt
GC content
0.5900

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1724.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1796.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 938.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001128922.2 NCBI
GGUGGGGCAGCUGAGCGGCCUGCUCCUCCUCGGGCCGUGACCCCGGGGU… 4207 nt 0.5900
NM_001370187.1 NCBI
GGUGGGGCAGCUGAGCGGCCUGCUCCUCCUCGGGCCGUGACCCCGGGGU… 2659 nt 0.6190
NM_001370188.1 NCBI
AGAGAGGACCUCAGAGGCCAGACUGUGAGCUAGUCUGCCCUGCUCCUGC… 2702 nt 0.6058
NM_001370189.1 NCBI
AGAGAGGACCUCAGAGGCCAGACUGUGAGCUAGUCUGCCCUGCUCCUGC… 4273 nt 0.5818
NM_001370190.1 NCBI
GGUGGGGCAGCUGAGCGGCCUGCUCCUCCUCGGGCCGUGACCCCGGGGU… 4119 nt 0.5899
NM_001370191.1 NCBI
GGUGGGGCAGCUGAGCGGCCUGCUCCUCCUCGGGCCGUGACCCCGGGGU… 733 nt 0.5839
NM_005512.3 NCBI
ACUCUGCCAGUAAGUCAGCUGAGGCCGAGAGGAGGGAGAGAGGACCUCA… 4286 nt 0.5821
Summary

This gene encodes a type I membrane protein which contains 20 leucine-rich repeats. Alterations in the chromosomal region 11q13-11q14 are involved in several pathologies. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the LRRC32 was identified as a high-confidence gene in common between mice and humans within the top 10% of genes related to lifetime alcohol consumption [Farris et al. DOI:10.1038/Mp.2014.159].