Basic Information

Symbol
LRRC4
RNA class
mRNA
Alias
Leucine Rich Repeat Containing 4 NGL-2 NAG14 Nasopharyngeal Carcinoma-Associated Gene 14 Protein Leucine-Rich Repeat-Containing Protein 4 Brain Tumor-Associated Protein BAG Netrin-G Ligand-2 Netrin-G2 Ligand Brain Tumor Associated Protein LRRC4 Leucine-Rich Repeat-Containing 4 BAG
Location (GRCh38)
7:128027071-128032128
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022143.5
Sequence length
4195.0 nt
GC content
0.5266

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1557.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1631.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 887.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_022143.5 NCBI
GACCGCAAUCAGCUGCCGCCGGCCCGGAGCGGCCGACGCCGGGAGAGGG… 4195 nt 0.5266
Summary

Predicted to be involved in modulation of chemical synaptic transmission and synapse organization. Predicted to act upstream of or within synapse organization. Predicted to be located in dendritic spine; excitatory synapse; and postsynaptic membrane. Predicted to be active in Schaffer collateral - CA1 synapse; glutamatergic synapse; and postsynaptic density membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the LRRC4 was identified as a hub gene related to synaptic plasticity in the ventral tegmental area during the post-addiction phase of nicotine self-administration [Fan et al. DOI:10.1016/J.Jgg.2024.08.009].