Basic Information

Symbol
LRRC4B
RNA class
mRNA
Alias
Leucine Rich Repeat Containing 4B NGL-3 Netrin-G3 Ligand LRIG4 HSM Leucine-Rich Repeats And Immunoglobulin-Like Domains 4 Leucine-Rich Repeat-Containing Protein 4B Netrin-G Ligand-3 DKFZp761A179
Location (GRCh38)
19:50516892-50568435
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001080457.2
Sequence length
3348.0 nt
GC content
0.6804

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1625.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1673.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 974.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((((((((((.(.((....((((.((........)).))))...)).).)))))))))).)))(((((((((.(((((...((((.((((((((((..((((..(.(((.(.(((((((..(((((((((((.(((..((..(..((((((.(((((..(((.((..(((((...(((((.......((..(((.........((.(((((((((((..((((((..((..(((.(((.((((((.(.((((((((((..(((((..((((((.(((((((..((((((.(((((((....(((((((((...........)))))))))((((.(((((.(.((.....(((..(((....)))..))))))))))))))))))))))(((........)))..........((((...(((((((.....))))))).)))).(((..(((((((((((((.(((....))).((((((((((.....(((....)))))))).........))))).(((.(((.(((((.(((.((.((((((((.((((((((..(((.(((((((..((((..((((((((.....(((((.(((((......(((((....)))))))))).))))).((((((((((.(.((...(((.((...)).)))....))))))))).))))))))))))))))..(((.(((((....((((...((((.(((...((.((.(((.((...(((((.(......).)))))..))))))))).))).)))).))))...))))).)))...))))))).((((....(((((....)))))((((.((.((((((((.((...((((((......)).)))))).)))))........(((((((((((((.....)))).))))).))))....))).)).))))........(((((((((((((((.....((((((((((((((......((((.((((((((((((((.(.((.((......)))).).))))).))))...((.(((((....(((.((((((.....).))))).)))....))))))).....)))))))))......)))))))))((((.(((((((((.((....))...))).))))....((((.((((.(........).)))).))))....)).))))((((((..((((((((((((.(.((.((((((...((....)).))))))..)).).)))))).))))))....)))))).)))))...))))))).....((((((..(((.((((......((((......((((((.((((.....)))).))))))(((((....(((......))).((((((((.((.(((((.............((....))...(((..(((((((((((...((((((.......)))..)))....))).)))))))).)))((((((((((((.((..((.((((.((.(((((........))))).))))).).)).)).).))))))).)))).))))))).))))))))))))).(((..(.(((((..(....)..))))))..))).(((.(.((((((((.(((((......))..))).))))..)))).))))))))...(((((...((((..(.(((((((....))))..)))..)..))))..)))))..............)))))))...))))))((....(((((......)))))...)).............((((((((((((.(..((......))...).))))))))))))...))))))))......)))).((.((((((((.....)))...))))).)))))..)))))))).)))))))).)).))).))))).)))))))))))))..((((((((.(((((((.((((((.(((......((((((...((((((((.((((((.(.((.((((.(((..(((....((((.((((((((....)))))((.(((........))))).((((((((..(((((...)))))..))))(((((((((((....)).))))))))).((.(((((((((((...(((....)))(((((.....))))).((((((.((.(((((((.(.((.(.((((...)))).))).).))))))).))..((.((((((((..(((((((((.(..((............))..)))))))))).....)))))).))))((((((..((((((((..........(((((....)))))....(((.....))).)))))))).))).))).))))))...........))))))))))))).))))))).)))))))))).)))).)).).)))))).))))))))..))))))(((((((.(((((((.(..(((....)))..).)))))))......(((.....)))...)))))))....))).)))))).))))))).)).)))))).))))))..))).))))))))))))).))))))....((((((((((((((..(.((.((...((...(((((((((.....(((.(((....)))..)))....)))).))))))).)))).)..))))))))))))))(.(((((.....))))).).....((((((.(..(((((...)))))..))))))).((((((((...(((((.((((.(((((((((.((((..................))))..(((((((((....)))))).)))..))))).))))...)))).)))))...)))).)))).)))))...)))))))))).).))))))....((((....))))(((((((((((((.(((((........)))).).)).)))))))))))....))).)))..))..))).)))..))))))))))).)).((((((((.....))))))))(((((........)))))..))))).....))))))))))..)))))..))))).))))))..)..))...))).))))))..))))).))))(((....)))...((((....))))))).).))).)..))))..)))))((((((.((((((((((((((......)))))))).))))))))))))..))))).)))).)))))....)))))(((((..((((.......))))(.((((...((....))...)))).))))))......................((((((((((......))))))))))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((((((((((((((({,..,(((,,({...{(({.|,.}}})}},)).},))))))))))},))))|}}}((({(((((.,((({((((,((((((((({(((,.{.(((((.(({((((..(((((((((((,,(({.((..(..((((((.(((((..({({((..,{{{{...{{{{{...{,,,((,,(({.....{{..((.(((((((((((..((((((,{(({{((,.(({.((((((.(.((((((((((..(((((,.{(((({{.(((((((((.,..(((((((((...,(((((((((...........)))))))))|(((.(((((.(.((,....(((..(((....)))..)))})}))))))))}))))))))){((((((.((((((.((((((.((((...(((((((,...,))))))).))))(((((((((.(((.,((((((((....))).)))..(((((.....(((....))))))))...........))..)))))))))))).((((((...((((((.(((..(((((((((.{(((((({,({{,..{|||||||,.,,,({(((,(((((......(((((....})))))))}|,||}|},(({(((((((.(.((.,.(((,((,,.||||}}.,,,)}))))))),|)))})))}}}|}||}..(((.(((((....((((...((((.(((...((.((.(((.((...(((((.(......).)))))..))))))))).))).)))).))))...))))).)))...}))}}}}{((((....(((((....)))))...}}}}|(({{((((.((...((((((......))},))))).))))))),.,,,,(((((((((((((.....)))).))))},))))..,,.{|{||.,|.....,....))))}||,{(({(((((,,.((((((((((((((......(((,,((((((((((((((.(.((.((......)))).).))))).))))...{{.(((((....(((.((((({.....}.))))).)))....)))))}}.....)))))))))......))))))))|((((({,..})))))},....))})}),...,{{{...((((.((((.(........).)))).))))...})}.((({(((((({.,,((,.((((((((.,{{((((({,..|||||.||.||{..{{{{{(((((((,,{(((((((((((.,.{(({(((((..(.{((((((..{(,.....,,,}})))))}.,.}..))))).,.((((((.((((.....)))).)))))).},{{....(((......}}}.,.|||,(({(({(((((.....,,{.,,,(((((({.....(((..(((((((((((...((((((.......)))..)))....))),}))))))).)))((((((((((((.((.,(({,(((.((.(((((.,.....,))))).)))))}).)).)).)}}})))))},)))})))))),.,,,,})))|||||||,,..{,(((((..{....}..)))))|,,|||.{(({({(({{({{{,({{,{,.....|||,,,|,|||}.,|(|{.,,,))),,...{((((...((((..(.(((((((....))))..)))..)..))))..))))},}}}}.}),}...|||||,,....((((({,,....,((((..,.,,)})))))))).............((((((((((((.{..{(......))...).))))))))))))...,,}))))}{((((((((({((.((((((((.....)))...))))).)}.((((((.((.(((((.....))))).)).))))))||,((((..,)))).))))))))))))},})))))})))))))))............|(((({,,.)}))))))))))))))}..}.))))))).,.||,,,(({{((.,,,)))))),.})))..}}}..)|))).||||}}.,}}}}|{|{{,({,{((((((((,(((({,,,({{{{||.|||,},,,,.|}}.}|}}}}}.....}))).))))))))|{|}.,,,})}|||{|.,.({(,.(((((((.(.({.(.((((...)))).})),}.)))))))}))..}|.||{|||||.,|||{{((((.{{{(,...,,,,,,..,||,,|}}}||||}}...,,))},}}.|||||{||||,,,,,|)})),)}}}.....(((((....))))).)))})))).),.))}))),))))}...,.))})))))).},,}.....,||}}}}})})}}}..(((((((((((((,,({(({{|{{(((.((((((((.((((.((.{{((({((((((({((((((({.{{(,,..}}),)}})})))))}}.,{...(((.....))).,)))))}))}},..||,((((((((((...))))).......)))))..)}}},)).)))).)))))))).)))..(((((.....))))).....,....||||....{(((((((...}))))}}(((....)))..))),...),))})),),.))))))))))))))))))))))))).)))))).)))))).........((((((((...((((...(,{((...((((......,,)))).)))}...)))).....))))))))...)))))).)))))).,.{{.((..(((((((((....)))))).))),}})}.)}))))....)))))))))...)).).)).,.)))))...)))))))))).).))))))...,}}}|},{,|(((((((((((((((((.((((........)))).)}}).))))))))))))).}),),,))..))..)))}}))..))))))))))).)).{{((((((,{...)))))))){((((......,.)))))..))))).....))))))))))..)))))..))))).))))))..)..)).}})}).))))))..))))).)))){{,....}}}...((((,...))}),}}.}.}},,))})))}.})))),((((((.((((((((((((({......}))))))).)))))}))))))})).)))}))))),)))).)))))))).(((,....,,,}...},}.{(({((((...((....))...)))).)))),,....,.,,,.............{(((((((((......}))))))))}))))......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001080457.2 NCBI
AGUAUUCCGCUCCCGUCUCCGCCGCUCUCGGCUGCUCUCGGUCGCUGCC… 3348 nt 0.6804
NM_001348568.1 NCBI
AUGCGGAGGUAGACAUGGCAGCGGCAGGCCUGGAGGCCGGGGUGGGUGC… 3019 nt 0.6678
Summary

Predicted to enable signaling receptor binding activity. Predicted to be involved in regulation of synapse assembly and synaptic membrane adhesion. Predicted to be located in cerebellar mossy fiber and presynaptic membrane. Predicted to be active in glutamatergic synapse and postsynaptic density membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that exercise intervention in methamphetamine-addicted subjects significantly altered hippocampal gene expression, identifying 12 differentially expressed genes including the LRRC4B which was downregulated in the exercised, addicted group [Li et al. DOI:10.21037/Atm-22-450].