Basic Information

Symbol
LRRFIP1
RNA class
mRNA
Alias
LRR Binding FLII Interacting Protein 1 TRIP GCF2 GC-Binding Factor 2 FLIIAP1 FLAP-1 HUFI-1 GCF-2 Leucine-Rich Repeat Flightless-Interacting Protein 1 Leucine Rich Repeat (In FLII) Interacting Protein 1 LRR FLII-Interacting Protein 1 TAR RNA-Interacting Protein NEDD8-Conjugating Enzyme FLAP1
Location (GRCh38)
2:237627554-237813682
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden death from CNS diseases
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001137550.2
Sequence length
4092.0 nt
GC content
0.4724

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1283.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1352.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1069.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001137550.2 NCBI
GGGGCGGCGCGAGCGGCUGGAGCAACGGGCCCCGCGGCAGCUGCGGGCG… 4092 nt 0.4724
NM_001137552.2 NCBI
GCCCUUCCACCCCGAGCCCGACUCAGCCCGCGGCCACCUGCGCCCCGCC… 4453 nt 0.4453
NM_001137553.2 NCBI
GCCCUUCCACCCCGAGCCCGACUCAGCCCGCGGCCACCUGCGCCCCGCC… 4285 nt 0.4441
NM_004735.4 NCBI
GCCCUUCCACCCCGAGCCCGACUCAGCCCGCGGCCACCUGCGCCCCGCC… 4381 nt 0.4460
Summary

Enables DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity; and protein homodimerization activity. Involved in negative regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in cytosol and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the LRRFIP1 is significantly up-regulated in the piriform cortex following sarin-induced seizure onset, with its expression increasing over a 24-hour time course and peaking at 24 hours [Spradling et al. DOI:10.1186/1742-2094-8-83].