Basic Information

Symbol
LRRK2
RNA class
mRNA
Alias
Leucine Rich Repeat Kinase 2 Dardarin ROCO2 RIPK7 PARK8 Leucine-Rich Repeat Serine/Threonine-Protein Kinase 2 DKFZp434H2111 FLJ45829 Parkinson Disease (Autosomal Dominant) 8 Augmented In Rheumatoid Arthritis 17 EC 2.7.11.1 EC 3.6.5.- AURA17
Location (GRCh38)
12:40196744-40369285
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_198578.4
Sequence length
9239.0 nt
GC content
0.3888

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2497.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2682.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1967.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_198578.4 NCBI
GGGGCCCGCGGGGAGCGCUGGCUGCGGGCGGUGAGCUGAGCUCGCCCCC… 9239 nt 0.3888
Summary

This gene is a member of the leucine-rich repeat kinase family and encodes a protein with an ankryin repeat region, a leucine-rich repeat (LRR) domain, a kinase domain, a DFG-like motif, a RAS domain, a GTPase domain, a MLK-like domain, and a WD40 domain. The protein is present largely in the cytoplasm but also associates with the mitochondrial outer membrane. Mutations in this gene have been associated with Parkinson disease-8. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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