Basic Information

Symbol
LRRN3
RNA class
mRNA
Alias
Leucine Rich Repeat Neuronal 3 FIGLER5 NLRR3 Fibronectin Type III, Immunoglobulin And Leucine Rich Repeat Domains 5 Leucine-Rich Repeat Neuronal Protein 3 Neuronal Leucine-Rich Repeat Protein 3 FLJ11129 NLRR-3 Leucine-Rich Repeat Protein, Neuronal 3
Location (GRCh38)
7:111091006-111125454
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001099658.2
Sequence length
3500.0 nt
GC content
0.3840

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-826.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -894.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 975.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001099658.2 NCBI
GUCAGUGUGACAACUGAUCGGGUGAACGAUGCACCACUAACCACCAUGG… 3500 nt 0.3840
NM_001099660.2 NCBI
GUCAGUGUGACAACUGAUCGGGUGAACGAUGCACCACUAACCACCAUGG… 3607 nt 0.3845
NM_018334.5 NCBI
GUCAGUGUGACAACUGAUCGGGUGAACGAUGCACCACUAACCACCAUGG… 3418 nt 0.3815
Summary

Predicted to act upstream of or within positive regulation of synapse assembly. Predicted to be located in membrane. Predicted to be active in extracellular matrix and extracellular space. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the LRRN3 is down-regulated with increasing age in blood, serving as an mRNA marker for age estimation [Zubakov et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2016.05.014]. In a separate investigation of acute myocardial infarction patients, the LRRN3 was identified as a differentially expressed gene among the top 10 when comparing samples taken at 1 day versus 3 months post-event [Wang et al. DOI:10.1038/s41598-024-60945-3].