Basic Information

Symbol
LTA4H
RNA class
mRNA
Alias
Leukotriene A4 Hydrolase Tripeptide Aminopeptidase LTA4H Leukotriene A-4 Hydrolase LTA-4 Hydrolase Testicular Secretory Protein Li 27 Leukotriene A(4) Hydrolase EC 3.4.11.4 EC 3.3.2.6 LTA4
Location (GRCh38)
12:96000753-96043520
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000895.3
Sequence length
2140.0 nt
GC content
0.4280

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-590.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -631.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 660.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000895.3 NCBI
CUCUAUCGACGAGUCUGGUAGCUGAGCGUUGGGCUGUAGGUCGCUGUGC… 2140 nt 0.4280
NM_001256643.1 NCBI
AUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGACUACAGGCGCAUGUUU… 2145 nt 0.4135
NM_001256644.1 NCBI
AUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGACUACAGGCGCAUGUUU… 2062 nt 0.4132
NM_001414263.1 NCBI
CUCUAUCGACGAGUCUGGUAGCUGAGCGUUGGGCUGUAGGUCGCUGUGC… 2044 nt 0.4291
NM_001414264.1 NCBI
CUCUAUCGACGAGUCUGGUAGCUGAGCGUUGGGCUGUAGGUCGCUGUGC… 2035 nt 0.4280
NM_001414265.1 NCBI
CUCUAUCGACGAGUCUGGUAGCUGAGCGUUGGGCUGUAGGUCGCUGUGC… 2057 nt 0.4283
NM_001414266.1 NCBI
CUCUAUCGACGAGUCUGGUAGCUGAGCGUUGGGCUGUAGGUCGCUGUGC… 2209 nt 0.4233
Summary

The protein encoded by this gene is an enzyme that contains both hydrolase and aminopeptidase activities. The hydrolase activity is used in the final step of the biosynthesis of leukotriene B4, a proinflammatory mediator. The aminopeptidase activity has been shown to degrade proline-glycine-proline (PGP), a neutrophil chemoattractant and biomarker for chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2015]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the LTA4H mRNA in salivary extracellular vesicles was significantly upregulated in emergency department patients with acute traumatic brain injury compared to healthy participants [Cheng et al. DOI:10.4103/1673-5374.266924].