Basic Information

Symbol
LTAP1
RNA class
mRNA
Alias
Lipid Transport Auxiliary Protein 1 NICE-3 Hepatitis C Virus NS5A-Transactivated Protein 4 Chromosome 1 Open Reading Frame 43 HCV NS5A-Transactivated Protein 4 Protein C1orf43 DKFZp586G1722 C1orf43 NS5ATP4 S863-3 NICE3 Uncharacterized Protein C1orf43 Protein NICE-3 HSPC012
Location (GRCh38)
1:154206668-154220681
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001098616.3
Sequence length
1678.0 nt
GC content
0.4827

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-540.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -573.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 451.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001098616.3 NCBI
CUCCUUUCCCAGCUCUCCUGCCUGUCCGCCAUGUUUUCAGGCCGGGUCU… 1678 nt 0.4827
NM_001297717.2 NCBI
CUCCUUUCCCAGCUCUCCUGCCUGUCCGCCAUGUUUUCAGGCCGGGUCU… 1565 nt 0.4805
NM_001297718.2 NCBI
CUCCUUUCCCAGCUCUCCUGCCUGUCCGCCAUGUUUUCAGGCCGGGUCU… 1601 nt 0.4747
NM_001297720.2 NCBI
CUCCUUUCCCAGCUCUCCUGCCUGUCCGCCAUGUUUUCAGGCCGGGUCU… 1624 nt 0.4840
NM_001297721.2 NCBI
CUCCUUUCCCAGCUCUCCUGCCUGUCCGCCAUGUUUUCAGGCCGGGUCU… 1506 nt 0.5060
NM_001297723.2 NCBI
CUCCUUUCCCAGCUCUCCUGCCUGUCCGCCAUGUUUUCAGGCCGGGUCU… 1608 nt 0.5031
NM_015449.4 NCBI
CUCCUUUCCCAGCUCUCCUGCCUGUCCGCCAUGUUUUCAGGCCGGGUCU… 1576 nt 0.4841
NM_138740.4 NCBI
CUCCUUUCCCAGCUCUCCUGCCUGUCCGCCAUGUUUUCAGGCCGGGUCU… 1522 nt 0.4855
Summary

Involved in phagocytosis. Located in Golgi apparatus; cytosol; and mitochondrion. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the LTAP1 as a housekeeping gene with highly uniform and strong expression across 16 normal tissue types, proposing it for calibration in biotechnological applications and genomic studies due to its exceptionally constant expression level [Eisenberg and Levanon DOI:10.1016/j.tig.2013.05.010].