Basic Information

Symbol
LTF
RNA class
mRNA
Alias
Lactotransferrin HLF2 Growth-Inhibiting Protein 12 Talalactoferrin GIG12 LF Epididymis Luminal Protein 110 Neutrophil Lactoferrin Lactoferricin Lactoferroxin Lactoferrin EC 3.4.21.- Kaliocin-1 EC 3.4.21 HEL110
Location (GRCh38)
3:46435645-46485234
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002343.6
Sequence length
2721.0 nt
GC content
0.5270

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-993.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1041.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 496.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001199149.2 NCBI
AGAGUUGCACCACUGGGUUUUAUAUUCACUUGGAUCUUUAGUUGUUUUG… 2851 nt 0.5244
NM_001321121.2 NCBI
AGAGCCUUCGUUUGCCAAGUCGCCUCCAGACCGCAGACAUGAAACUUGU… 2715 nt 0.5267
NM_001321122.2 NCBI
ACGUGGCCUUCACAGCUGGCCUGAGUGAGCACAGCGGGCACUGAGGGGA… 3212 nt 0.5318
NM_002343.6 NCBI
AGAGCCUUCGUUUGCCAAGUCGCCUCCAGACCGCAGACAUGAAACUUGU… 2721 nt 0.5270
Summary

This gene is a member of the transferrin family of genes and its protein product is found in the secondary granules of neutrophils. The protein is a major iron-binding protein in milk and body secretions with an antimicrobial activity, making it an important component of the non-specific immune system. The protein demonstrates a broad spectrum of properties, including regulation of iron homeostasis, host defense against a broad range of microbial infections, anti-inflammatory activity, regulation of cellular growth and differentiation and protection against cancer development and metastasis. Antimicrobial, antiviral, antifungal and antiparasitic activity has been found for this protein and its peptides. Activity against both DNA and RNA viruses has been found, including activity against SARS-CoV-2, and HIV. [provided by RefSeq, Jul 2021]

Forensic Context

A study in humans identified the LTF as one of 19 center genes commonly differentially expressed in blood samples from burn patients across early-stage (<11 days), middle-stage (11-49 days), and control groups, indicating its association with burn injury progression [Wu et al. DOI:10.007/s10753-018-0829-0]. Another human study found the LTF was significantly up-regulated (fold change 2.39) in leukocytes from patients with burn sizes >40% total body surface area within one week post-burn, further associating it with this severe injury parameter [Sood et al. DOI:10.0000000000000905].