Basic Information

Symbol
LXN
RNA class
mRNA
Alias
Latexin Endogenous Carboxypeptidase Inhibitor Tissue Carboxypeptidase Inhibitor ECI TCI Protein MUM MUM
Location (GRCh38)
3:158645822-158672648
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020169.4
Sequence length
1071.0 nt
GC content
0.4211

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-264.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -285.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 333.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_020169.4 NCBI
AAACAGCAGCUUCCGGAGUCGGAAGGAGCUGAGGAAGAAGACUGACUGA… 1071 nt 0.4211
Summary

This gene encodes the only known protein inhibitor of zinc-dependent metallocarboxypeptidases. The encoded protein, latexin, downregulates the population size of hematopoietic stem cells. This protein is found to be downregulated in cancer cells because of promoter hypermethylation. [provided by RefSeq, Jul 2020]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.