Basic Information

Symbol
LY75-CD302
RNA class
mRNA
Alias
LY75-CD302 Readthrough C-Type Lectin Domain Family 13 Member B LY75-CD302 Fusion Protein Lymphocyte Antigen 75 DEC-205/DCL-1 Fusion Gp200-MR6 CLEC13B DEC-205 CD205 Ly-75 LY75
Location (GRCh38)
2:159771851-159904710
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001198759.1
Sequence length
8919.0 nt
GC content
0.3949

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2390.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2562.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2281.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001198759.1 NCBI
AGGCCGCGCUCAGCAGGCGGGGCGGGAGCCGCGUGCGCCCGAGGACCCG… 8919 nt 0.3949
NM_001198760.1 NCBI
AGGCCGCGCUCAGCAGGCGGGGCGGGAGCCGCGUGCGCCCGAGGACCCG… 8751 nt 0.3950
Summary

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring lymphocyte antigen 75 (LY75) and CD302 molecule (CD302) genes. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding fusion products that share sequence identity with each individual gene product. [provided by RefSeq, Nov 2010]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the LY75-CD302 gene was overexpressed in menstrual blood-derived mesenchymal stem cells from women with endometriosis compared to healthy controls [Penariol et al. DOI:10.3390/ijms231911515].