Basic Information

Symbol
LYAR
RNA class
mRNA
Alias
Ly1 Antibody Reactive Cell Growth-Regulating Nucleolar Protein ZC2HC2 ZLYAR Ly1 Antibody Reactive Homolog (Mouse) Ly1 Antibody Reactive Homolog
Location (GRCh38)
4:4267572-4290196
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017816.3
Sequence length
1554.0 nt
GC content
0.4311

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-398.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -428.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 484.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145725.2 NCBI
CCCAGAGGUCCGACCUGGGAGGCUGGGGCUCAGAGAGCAAUGUUUGCUG… 1471 nt 0.4160
NM_017816.3 NCBI
AGAAGCGAAUUCUGCACCGCGAAGCCUGAGAGGCAGGUAGCUGCGGCGC… 1554 nt 0.4311
Summary

Enables several functions, including DNA-binding transcription factor binding activity; identical protein binding activity; and transcription regulator inhibitor activity. Involved in several processes, including erythrocyte development; negative regulation of innate immune response; and regulation of DNA-templated transcription. Located in nucleolus and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the LYAR as part of a 13-gene prediction model (HF.Sig) derived from peripheral blood immune cell analysis that could accurately distinguish between post-myocardial infarction heart failure and non-heart failure patients, achieving an area under the curve of 1 in validation [Sun et al. DOI:10.3389/fimmu.2023.1163350].