Basic Information

Symbol
LYN
RNA class
mRNA
Alias
LYN Proto-Oncogene, Src Family Tyrosine Kinase JTK8 V-Yes-1 Yamaguchi Sarcoma Viral Related Oncogene Homolog Lck/Yes-Related Novel Protein Tyrosine Kinase Tyrosine-Protein Kinase Lyn EC 2.7.10.2 P53Lyn P56Lyn EC 2.7.10 SAIDV
Location (GRCh38)
8:55879825-56014169
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002350.4
Sequence length
5872.0 nt
GC content
0.4559

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1907.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2014.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1551.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001111097.3 NCBI
AGUUCCUCUCCCGCCGCGCCGGGCCGCGCUGCCGCUCGCUCCCCGGCCG… 5809 nt 0.4567
NM_002350.4 NCBI
AGUUCCUCUCCCGCCGCGCCGGGCCGCGCUGCCGCUCGCUCCCCGGCCG… 5872 nt 0.4559
Summary

This gene encodes a tyrosine protein kinase, which maybe involved in the regulation of mast cell degranulation, and erythroid differentiation. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2011] CIViC Summary for LYN Gene

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.