Basic Information

Symbol
LYPLA2
RNA class
mRNA
Alias
Lysophospholipase 2 APT-2 Acyl-Protein Thioesterase 2 Lysophospholipase II APT2 Palmitoyl-Protein Hydrolase LysoPLA II LPL-II Testicular Tissue Protein Li 3 EC 3.1.2.22 EC 3.1.2.- DJ886K2.4 EC 3.1.2
Location (GRCh38)
1:23791110-23795544
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007260.3
Sequence length
1635.0 nt
GC content
0.6159

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-702.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -731.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 579.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.....).))))))(((.......)))...(((((((....(((((.(((((.(((.(((((((.((((((((.((((((.....(((...)))...))))))...((((((..((((((((((((((.....)).))))))).........(((((((((((((((.......))))).))...))))))))..))))))))))).......(((((((((...((((((...((((((((((((((....)))).(((((((...(((((((.(((.(((((((.(((........))).))((((((....(((.(((.((........)).))).)))...)))))).))))).))).)))))))...((((((((((((((((..(.((..((((.....(((((....((.....))...)))))(((((.(((.............((....))))))))))....(((((((.(((....))).)))))))(((((.(((......))).))))).....)))))))..)))))))..)))))).)))(.(((.((((((((((((((.......(((......)))))))))))...))))))..))).).(((.((((((((((...(((((((((.......)))))))))(((((((((((..(((((((((..((((((((((((((((((((((((((..((((((..(((.((((((((((........((((((((((((((...))))...((((((.((((((((.(.((((....)))).)..)))))))).))))))...........(((((((((.(((.(((......)))))).)))).).))))......)))))))))).))))))).))).)))((((..(((((((((((((.....((((................))))....)))))))))).)))..)))).(((((((........)))))))..(((..((((.((((((.....)))))).))))..)))......((((......))))))))))......))))))))).))))))(((((...(((..((.((((...((((((((((.((((..........................))))...))..)))))))))))).))..)))..((((...))))..((((((......)))))).)))))..((((....((..(((((....)))))...))......))))..)))))))))))........(((....))).))))).))))..)))).))))))).(((.......)))..)))))).)))).))).)))))))......(((((((((((((((((((.(((......)))))))))))..))))))).)))).((...(((((((..((((((((((.....))))))))))..)))..).)))...))((((((((..((((((((.((....(((((.........)))))..)))))))))))))))))))))))))))).))))))....)))))))))..)))))))).))))))).)).).))))).)....))))...............)))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.....),}))))){(,(((((((((((.{((((.(({.((((,(({((((,....,{{{....,|{|||..|}(((({(.....(((...))}.}.)))))))))))|({(((((((.(((((({{{{.{{,,,.,))))}|{,(((((((((((((({((({{(({,,..,,||}||,}},,,}}}}))))..,,))}}))))}.........|}||}}..,||{{|,,.,|((({|((((.{{||,}..)))),,,,)))))}.))))))}.,||}}.,.|}}}}}}}}.}}}}}.}).))}..(((,{(,.(.{((,.,({{{{.{{{||.,,|((((((..(((.((....{((..((((((,..........)))))).})))).)))..))))))}((((((((((.,{,....{{{(,((((((((((.(((.{...,.......,,..,.},))))))))}}..{(((((({(({...,})).))))))|(((((.(((......))).))))),..|,|((({(((.....}}|,.||||{{{{||},||,|{{{.||,{((((({{{{|..|((({....,|{{{((|,|{{{{,(({((,{{,{,{{.{{||||{{..,,,,,|||||{|||||,,,,.,,)})))))))))}.|}.,||,,{|{((({{{{,{(({{|||||||}|,{|,,||}|,|}|,|||||,|}||||}|,{{{{{,({,.......{(|{{{{{((,{{((,.|{{{...((((((.{(((((((.{.{(((....}))).,..)))))))}.))))))....,,.,}.,|||||{|||,|{|,(({.{{{({.,...)))))|.}}}}}}..}}..))))))))}),}))))}}})))))}}((((..(((((((((((((.....,,,(.{{{(,.........}))))....)))))))))).)))..))))}|||||||||},....}))}}))}}|||,.||||},,,,|||}}..))))))}))))}})))}}}},{{{{{...{{{{|||||{|{{|{||||,,||.,,,)}...)),)))))...{(({((({(({(...((((((((((({(((({{{.{{{{.||||,(((((.(((((((((...,,..((((((...(((((......)))))...)))))).((((((......))))))............{{((((((((......,.{,{....(((.,((.(((((((.....)))}..))).}),))}...))}..(((((..(((..,,....},)))..)))))...))))))))))),)))))))))))))).,|||,,..||||||||,...,}}}))))).....(((({...)))))))))))))))).,||},,,,,,,||,(((..((((((((((.....))))))))))..))).,}|})}.,|)}|,,.,|,|}))}))}||..((((((((.(,((((..{{....))..)))),),))))))))|}||{,,,..,))),}},.)))}))))).),))....)))))).))))),))))).)))),))},))}........,.....,,,.)))))),}..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_007260.3 NCBI
GGGACUCGAACGGAAGUUCCGGCGGGGGCGGCCGAGGGGGAAGAGUGUG… 1635 nt 0.6159
Summary

Lysophospholipases are enzymes that act on biological membranes to regulate the multifunctional lysophospholipids. There are alternatively spliced transcript variants described for this gene but the full length nature is not known yet. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the protein lysophospholipase 2 (Lypla2) was identified as a potential target of the LYPLA2 in primary cardiomyocytes, where its protein level was downregulated following transfection with a miR-483-3p mimic, though this effect was not statistically significant [Xue et al. DOI:10.1161/JAHA.122.026160].